典型文献
数量性状主基因+多基因混合遗传分析R软件包SEA v2.0
文献摘要:
利用双亲分离群体数量性状表型值可鉴定其主基因+多基因混合遗传模型,为数量性状遗传基础和作物育种提供参考信息.为全面总结数量性状分离分析的研究成果、添加软件包新功能和矫正以前版本的缺陷,在R Stu-dio-1.4.1103平台和R编程语言框架下,开发了具有交互式图形用户界面的R软件包SEA v2.0.该软件可分析14种双亲分离群体类型,每种群体类型均有数据导入、数据分析、后验概率计算和分布曲线绘制4个模块.为节省计算时间,用doParallel包并行计算、data.table包读写数据和MASS包估计分布参数.用KScorrect、kolmim和shiny包简化程序.只要用户上传*.csv格式数据文件并设置相关参数,可快速显示计算结果.通过大豆结荚习性数据分析和Monte Carlo模拟研究,证实了SEA v2.0软件包的有效性.软件包可从下载.
文献关键词:
双亲分离群体;数量性状;主基因+多基因混合模型;R软件包;SEA
中图分类号:
作者姓名:
王靖天;张亚雯;杜应雯;任文龙;李宏福;孙文献;葛超;章元明
作者机构:
华中农业大学植物科学技术学院, 湖北武汉 430070
文献出处:
引用格式:
[1]王靖天;张亚雯;杜应雯;任文龙;李宏福;孙文献;葛超;章元明-.数量性状主基因+多基因混合遗传分析R软件包SEA v2.0)[J].作物学报,2022(06):1416-1424
A类:
双亲分离群体,doParallel,KScorrect,kolmim
B类:
主基因,多基因,混合遗传,遗传分析,软件包,SEA,v2,遗传模型,数量性状遗传,遗传基础,作物育种,考信,性状分离,分离分析,新功能,Stu,dio,编程语言,交互式,式图,图形用户界面,该软件,群体类型,数据导入,后验概率,概率计算,分布曲线,计算时间,并行计算,data,table,读写,MASS,分布参数,shiny,简化程序,csv,数据文件,大豆,结荚,习性,Monte,Carlo,下载,混合模型
AB值:
0.411802
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