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基于微滴数字PCR检测线粒体DNA低频异质性
文献摘要：
目的 基于微滴数字PCR(Droplet digital PCR,ddPCR)技术,建立线粒体DNA低频异质性检测方法.方法 针对DNA标准品9947A和HL-60线粒体分型不同的两个SNP位点(nt93和nt16311)以及9947A存在的异质性位点(nt1393、nt3242和nt7861)设计引物和探针,建立ddPCR反应体系,分别检测9947A和HL-60的6种不同混合比例(1∶1、1∶4、1∶9、1∶99、1∶999、1∶999 9)的异质性模型和9947A的异质性位点,并进行测序验证.结果 经过验证,所建方法成功检测出9947A的异质性位点,并能检测出异质性比例低至0.01％的位点.结论 本研究建立的基于ddPCR技术的检测方法,可用于线粒体低频异质性分析.
文献关键词：
ddPCR;线粒体DNA;低频异质性
中图分类号：
作者姓名：
漆小琴;王嘉慧;王雅雅;方晨;程凤;张晓梦;李娜;马鲁豫;王艳;严江伟
作者机构：
山西医科大学法医学院,山西晋中030600;山东第一医科大学临床与基础医学院(基础医学研究所),山东济南250117;中国人民解放军总医院医学创新研究部,北京100853
文献出处：
引用格式：
[1]漆小琴;王嘉慧;王雅雅;方晨;程凤;张晓梦;李娜;马鲁豫;王艳;严江伟-.基于微滴数字PCR检测线粒体DNA低频异质性)[J].中国法医学杂志,2022(06):579-583
A类：
低频异质性,nt93,nt16311,nt1393,nt3242,nt7861
B类：
检测线,Droplet,digital,ddPCR,标准品,9947A,HL,SNP,引物,反应体系,混合比例,异质性分析
AB值：
0.180904
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