典型文献
包头市九峰山青海云杉根系内生真菌的多样性及群落构建机制-基于三代测序技术
文献摘要:
植物内生真菌对植物的生长发育具有非常重要的作用.文中以包头市九峰山青海云杉为研究对象,基于Pacbio公司的三代测序技术-单分子实时测序(Single Molecule Real Time Sequencing,SMRT)对青海云杉根系内生真菌的内转录间隔区(Internal Transcribed Spacer,ITS)全长片段进行测序,检测青海云杉根系内生真菌的多样性和群落组成,并探究内生真菌的群落构建机制.文中共检测获得166个内生真菌可操纵分类单元(Operational Taxonomic Units,OTU),在门的分类水平上,子囊菌(Ascomycota)是最为优势的真菌类群,在科的水平上,柔膜菌科(Helotiaceae)最为优势,此外,139个OTU(占比83.7%)能够被鉴定到属的水平,133个OUT(占比80.1%)被鉴定到种的水平,其中四枝孢属(Tetracladium)是最优势的真菌属,同时,常见的内生真菌如Fusarium oxysporum,Aspergillus flavus和Trichoderma atroviride在文中也被检测出来.中性模型和过程性分析显示,内生真菌的群落构建主要是由随机性过程中的扩散限制所驱动.文中研究表明青海云杉根系具有丰富的内生真菌多样性,扩散限制主导了内生真菌的群落构建.研究为进一步探究青海云杉有益内生真菌资源及其功能利用等提供一定的理论依据.
文献关键词:
青海云杉;内生真菌;Pacbio SMRT三代测序;扩散限制
中图分类号:
作者姓名:
徐颖;樊永军;赵雅茹;张旋;王永龙
作者机构:
包头师范学院生物科学与技术学院,包头014030;内蒙古科技大学生命科学与技术学院,包头014010
文献出处:
引用格式:
[1]徐颖;樊永军;赵雅茹;张旋;王永龙-.包头市九峰山青海云杉根系内生真菌的多样性及群落构建机制-基于三代测序技术)[J].干旱区资源与环境,2022(08):119-124
A类:
Helotiaceae,四枝
B类:
包头市,九峰山,青海云杉,根系,群落构建机制,三代测序技术,植物内生真菌,对植,Pacbio,单分子实时测序,Single,Molecule,Real,Time,Sequencing,SMRT,内转录间隔区,Internal,Transcribed,Spacer,ITS,全长,长片,群落组成,可操纵,Operational,Taxonomic,Units,OTU,子囊菌,Ascomycota,真菌类,类群,OUT,枝孢属,Tetracladium,Fusarium,oxysporum,Aspergillus,flavus,Trichoderma,atroviride,过程性,随机性,扩散限制,中研,真菌多样性
AB值:
0.355483
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