典型文献
病原宏基因组高通量测序性能确认方案
文献摘要:
宏基因组学利用新一代高通量测序技术,以特定环境下病原体基因组为研究对象,在分析病原体多样性、种群结构、进化关系的基础上,进一步探究病原体的群体功能活性、相互作用及其与环境之间的关系,发掘潜在的生物学意义。目前,绝大部分的宏基因组学研究都集中在临床价值评价,宏基因组检测临床应用前分析性能确认的研究相对空白,北京协和医院检验科研究团队结合多年病原宏基因组检测的经验和国内外相关研究成果,就病原宏基因组项目医院本地化开展前的性能确认工作,从临床预期用途、方法学建立、性能确认、标准操作作业书4个方面提出了具体的实施方案,具体包含:标本类型和病原体范围、生物信息流程建立、生物信息分析参考盘制备和评估、湿实验流程的建立、背景核酸数据模型的建立、参考盘制备和全流程的性能确认等。
文献关键词:
病原;二代测序;宏基因组;性能确认;临床应用
中图分类号:
作者姓名:
张栋;张京家;杜娟;尚雪松;陈雨;吴洁;伊洁;杨卓;徐英春;杨启文
作者机构:
中国医学科学院北京协和医院检验科 疑难重症及罕见病国家重点实验室,北京 100730
文献出处:
引用格式:
[1]张栋;张京家;杜娟;尚雪松;陈雨;吴洁;伊洁;杨卓;徐英春;杨启文-.病原宏基因组高通量测序性能确认方案)[J].中华检验医学杂志,2022(09):899-905
A类:
B类:
病原宏基因组高通量测序,性能确认,宏基因组学,高通量测序技术,病原体,种群结构,进化关系,功能活性,生物学意义,绝大部分,组学研究,临床价值,价值评价,分析性能,北京协和医院,医院检验科,研究团队,组项,院本,本地化,方法学,标本类型,体范,信息流,生物信息分析,数据模型,二代测序
AB值:
0.263838
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