典型文献
血清代谢组指纹联合机器学习诊断肺癌
文献摘要:
目的:采用血清代谢指纹采集方法筛选肺癌相关差异调控代谢物,为肺癌诊断提供候选标志物。方法:在上海长海医院开展队列入组工作,共纳入2021年1月27日至6月4日的228例受试者,其中包括初诊确认肺癌患者97例和健康体检人群131名。根据标准流程采集入组队列血清样本,并通过分层随机抽样,将入组队列分为训练集和完全独立的验证集。采用纳米辅助激光解吸电离质谱对血清样品进行代谢指纹图谱采集。对训练集样本年龄、性别进行质量控制后,通过机器学习算法构建基于血清代谢指纹图谱的诊断模型,并采用受试者工作特征(ROC)曲线评价模型的分类效能。结果:通过新型纳米辅助激光解吸电离质谱,可在1 min内完成血清样品的代谢指纹提取,过程仅需消耗1 μl原始血清。针对训练集,基于此构建的分类器诊断肺癌的ROC曲线下面积(AUC)为0.92(95%
CI 0.87~0.97),敏感度为89%,特异度为89%。在独立验证队列中,AUC为0.96(95%
CI 0.90~1.00),敏感度为91%,特异度为94%,没有表现出性能损失。确定了由5个代谢物组成的标志物组合,展示了肺癌患者的独特代谢模式。
结论:本研究结合血清代谢指纹图谱和机器学习建立了肺癌的诊断模型,用于区分肺癌患者以及健康对照,可用于临床的体外诊断。
文献关键词:
质谱;肺癌;代谢组指纹;机器学习;实验诊断
中图分类号:
作者姓名:
张雨欣;贺琤雯;黄琳;钱昆;陈伟;贾音;胡晶晶;韦琴;王希平;刘善荣
作者机构:
上海交通大学生物医学工程学院和医疗机器人研究所,上海200030;海军军医大学附属长海医院实验诊断科,上海200433;上海市胸科医院检验科,上海200230
文献出处:
引用格式:
[1]张雨欣;贺琤雯;黄琳;钱昆;陈伟;贾音;胡晶晶;韦琴;王希平;刘善荣-.血清代谢组指纹联合机器学习诊断肺癌)[J].中华检验医学杂志,2022(03):226-233
A类:
代谢组指纹
B类:
联合机,学习诊断,用血,采集方法,肺癌诊断,长海,组工,初诊,肺癌患者,健康体检人群,标准流程,组队,血清样本,分层随机抽样,训练集,验证集,激光解吸,电离,指纹图谱,本年,机器学习算法,诊断模型,受试者工作特征,指纹提取,分类器,代谢物组,体外诊断,实验诊断
AB值:
0.249566
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