典型文献
应用生物信息学方法对着丝粒蛋白L进行泛癌中的免疫分析
文献摘要:
目的:探究着丝粒蛋白L(CENPL)在泛癌中的表达,并研究CENPL表达与免疫浸润之间的关系。方法:通过人类蛋白质图谱(HPA)和TIMER数据库探讨CENPL在人体正常组织及33种癌症类型中的基因表达情况。应用R语言计算了33种癌症的免疫细胞浸润、ESTIMATE评分、肿瘤突变负荷(TMB)、微卫星不稳定性(MSI)及免疫检查点基因相关性。结果:CENPL的mRNA表达水平在16种肿瘤中高于相对应的癌旁组织(
P<0.01)。CENPL表达与31种肿瘤中的免疫细胞浸润相关(
P<0.05)。此外,CENPL的表达水平与免疫评分相关性最高的肿瘤是肾上腺皮质癌(
R=-0.43,
P<0.01);基质评分相关性最高的肿瘤是睾丸癌(
R=-0.43,
P<0.01);免疫综合评分相关性最高的肿瘤是肾上腺皮质癌(
R=-0.39,
P<0.01)。CENPL表达与18种肿瘤的TMB呈正相关,与2种癌症的TMB呈负相关。CENPL表达与5种癌症的MSI呈正相关,与3种癌症的MSI呈负相关(
P<0.05)。在肾透明细胞癌中,CENPL的表达与40个免疫检查点的表达具有显著相关性(
P<0.05),差异有统计学意义。
结论:CENPL在泛癌中表达升高,与多种癌症的免疫浸润相关。
文献关键词:
着丝粒蛋白L;泛癌;免疫浸润
中图分类号:
作者姓名:
王芬;康金麟;李炫飞;冯茂辉;周福祥
作者机构:
武汉大学中南医院肿瘤放化疗科 湖北省肿瘤医学临床研究中心 肿瘤生物学行为湖北省重点实验室 430071;武汉大学中南医院胃肠外科 武汉市腹膜癌临床医学研究中心 430071
文献出处:
引用格式:
[1]王芬;康金麟;李炫飞;冯茂辉;周福祥-.应用生物信息学方法对着丝粒蛋白L进行泛癌中的免疫分析)[J].中华实验外科杂志,2022(04):707-709
A类:
CENPL
B类:
生物信息学方法,对着,着丝粒,泛癌,免疫分析,免疫浸润,类蛋白质,HPA,TIMER,正常组织,语言计算,免疫细胞浸润,ESTIMATE,肿瘤突变负荷,TMB,微卫星不稳定性,MSI,免疫检查点基因,癌旁组织,免疫评分,肾上腺皮质癌,睾丸癌,综合评分,肾透明细胞癌,显著相关性
AB值:
0.236157
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