典型文献
脑脊液二代测序在中枢神经系统感染中的病原学诊断价值
文献摘要:
目的:探讨宏基因组二代测序技术(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)在中枢神经系统(central nervous system,CNS)感染性疾病中的病原学诊断价值。方法:以2018年1月至2020年6月郑州大学第一附属医院收治的中枢神经系统感染患者为研究对象,根据纳入和排除标准最终确定170例患者。收集患者的一般临床资料以及病原体检测结果。纳入患者均送检常规以及mNGS检测,将检测结果分为常规方法检测组及mNGS检测组。符合正态分布的计量资料用均数±标准差(
±
s)表示;不符合正态分布的计量资料用中位数及四分位数表示;分类资料采用例数及百分比[
n(%)]表示;比较采用
χ2检验或Fisher's精确检验;一致性检验以Kappa值表示;对比分析两种方法对病原微生物的检出情况及检出病原谱的规律。
结果:在CNS感染性疾病中mNGS检测的总体阳性率高于常规方法(58.23%
vs. 18.82%),且差异有统计学意义(
P<0.01)。两种检测方法均阳性的20例样本中,所检出病原体种类完全一致者10例,完全不一致者和部分一致者各5例。在结核性神经系统感染病例检测中,检测阳性率从高到低依次为血T-SPOT、脑脊液mNGS、结核杆菌DNA、腺苷脱氨酶(ADA)以及结核特异性抗原抗体检测,分别为66.7%、53.8%、40.0%、24.0%、4.0%,抗酸染色阳性率为0%;mNGS与常规方法结合的检测阳性率为80.8%。
结论:脑脊液mNGS在CNS感染中病原菌检出率总体优于常规方法;但对结核杆菌的检测阳性率较T-SPOT未显示出明显优势;mNGS检测的病原菌更为广泛,有助于深入全面地了解中枢神经系统感染的菌种特点,两者结合在一定程度上弥补了临床常规检测的不足,可最大化提升检出率。
文献关键词:
中枢神经系统感染;宏基因组二代测序;常规方法;病原微生物
中图分类号:
作者姓名:
孟翠翠;袁丁;余言午;王金柱;郭建军;朱桂英;韦毅萌;陈继红;张蕾蕾;高艳霞
作者机构:
郑州大学第一附属医院郑东院区急救中心,郑州 450000;郑州市中心医院重症医学科,郑州 450001;郑州大学第一附属医院全科医学科,郑州 450000
文献出处:
引用格式:
[1]孟翠翠;袁丁;余言午;王金柱;郭建军;朱桂英;韦毅萌;陈继红;张蕾蕾;高艳霞-.脑脊液二代测序在中枢神经系统感染中的病原学诊断价值)[J].中华急诊医学杂志,2022(04):471-476
A类:
B类:
脑脊液,中枢神经系统感染,病原学诊断,诊断价值,宏基因组二代测序技术,metagenomic,next,generation,sequencing,mNGS,central,nervous,system,CNS,感染性疾病,郑州大学,感染患者,排除标准,病原体检测,送检,常规方法,正态分布,均数,中位数,四分位数,用例,Fisher,一致性检验,Kappa,病原微生物,检出情况,病原谱,体阳,完全一致,结核性,感染病,检测阳性率,SPOT,结核杆菌,腺苷脱氨酶,ADA,抗原抗体检测,抗酸染色,菌种,常规检测
AB值:
0.257826
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