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dndC基因在脉冲场凝胶电泳基因组降解中的作用及降解处理方法
文献摘要：
目的 了解大肠埃希菌和弗格森埃希菌dndC基因的携带情况,以及该基因与脉冲场凝胶电泳(PFGE)基因组降解表型之间的关系,探讨PFGE中菌株基因组降解的原因及处理方法.方法 使用PFGE对450株大肠埃希菌和弗格森埃希菌进行分析,设计引物检测dndC基因的携带情况并进行序列测定.通过dndC基因序列比对和进化树的构建,获得dndC基因型别以及其在不同型别大肠埃希菌中的分布.通过添加硫脲和消毒电泳仪研究基因组降解的处理方法.结果 450株大肠埃希菌和弗格森埃希菌中,降解的菌株为40株(8.89％).dndC基因阳性菌株33株(7.33％),均出现了降解.大肠埃希菌携带的dndC基因可分为8个群.不同型别大肠埃希菌中均存在dndC基因阳性菌株,且阳性率存在差异.添加硫脲可以有效缓解PFGE分析中
dndC基因导致的降解,电泳仪消毒可以缓解全胶降解的情况.结论 dndC基因会导致大肠埃希菌和弗格森埃希菌PFGE分析中基因组降解,添加硫脲可以缓解此降解.
文献关键词：
dndC基因;大肠埃希菌;弗格森埃希菌;脉冲场凝胶电泳;基因组降解;硫脲
中图分类号：
作者姓名：
濮吉;周娟;赫自强;熊衍文;金东
作者机构：
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,传染病预防控制国家重点实验室,北京102206
文献出处：
引用格式：
[1]濮吉;周娟;赫自强;熊衍文;金东-.dndC基因在脉冲场凝胶电泳基因组降解中的作用及降解处理方法)[J].疾病监测,2022(06):796-801
A类：
dndC,基因组降解,
dndC
B类：
脉冲场凝胶电泳,降解处理,大肠埃希菌,弗格森埃希菌,PFGE,解表,引物,序列测定,基因序列比对,进化树,基因型别,硫脲,电泳仪,阳性菌
AB值：
0.127296
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