典型文献
基于六邻体蛋白及纤维蛋白序列测定的腺病毒性结膜炎分类分析
文献摘要:
目的:基于六邻体蛋白和纤维蛋白的联合基因测序和系统发育分析进行腺病毒性结膜炎中人类腺病毒(HAdV)分型。方法:在上海地区收集2015年1月至2017年8月病毒性结膜炎患者下结膜囊结膜拭子样本256份,提取DNA后通过PCR扩增六邻体蛋白及纤维蛋白全长,完成基因测序及种系发生学分析。结果:89例(占34.76%)患者结膜拭子六邻体蛋白基因扩增阳性,包括HAdV-C1、HAdV-C2、HAdV-B3、HAdV-E4、HAdV-D8、HAdV-D19和HAdV-D37各1、7、20、6、23、17和15例,分别占1.12%、7.87%、22.47%、6.74%、25.84%、19.10%和16.85%,其六邻体蛋白种系发生学分析中均与相应参考序列原型聚合。纤维蛋白种系发生学分析中,15例HAdV-D19样本序列和1例HAdV-D37样本序列交叉聚合。结论:针对六邻体蛋白和纤维蛋白基因的联合测序可以为HAdV分型和毒力分析提供丰富有效的生物学信息。
文献关键词:
人类腺病毒;病毒性结膜炎;腺病毒六邻体蛋白;纤维蛋白;序列分析;系统发育
中图分类号:
作者姓名:
王旌;朱剑锋;陆丽娜
作者机构:
上海市眼病防治中心/上海市眼科医院 上海市第一人民医院 国家眼部疾病临床医学研究中心 上海市眼底病重点实验室 上海眼视觉与光医学工程技术研究中心 上海市眼科疾病精准诊疗工程技术研究中心,上海 200040
文献出处:
引用格式:
[1]王旌;朱剑锋;陆丽娜-.基于六邻体蛋白及纤维蛋白序列测定的腺病毒性结膜炎分类分析)[J].中华实验眼科杂志,2022(10):902-907
A类:
病毒性结膜炎,腺病毒六邻体蛋白
B类:
白及,纤维蛋白,序列测定,分类分析,基因测序,系统发育分析,人类腺病毒,HAdV,上海地区,结膜囊,子样本,全长,种系发生,发生学,基因扩增,C1,C2,B3,E4,D8,D19,D37,白种,参考序列,序列原型,毒力,序列分析
AB值:
0.215081
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