典型文献
利用RNA-Seq鉴定调控甘蓝型油菜叶片光合特性的低温胁迫应答基因
文献摘要：
明晰甘蓝型油菜光合特性对低温胁迫的响应,鉴定相关应答基因,以耐寒材料17NS和敏感材料NF24为研究对象,通过Illumina HiSeqTM 2000平台进行RNA-Seq分析,探讨-4℃处理24 h后甘蓝型油菜的叶片形态、光合参数、叶片超微结构、基因调控表达模式等响应低温胁迫的分子机制.结果表明,低温胁迫下甘蓝型油菜响应光合调控的显著富集途径为光合作用途径和光合作用-天线蛋白途径,这两种途径中有64个特异表达基因,其中8个上调表达,56个下调表达,大部分注释到分子组成和生物学过程中,证实了光合作用与低温胁迫导致的幼苗叶片萎蔫、叶绿体数量和形态发生变化、类囊体结构受损、相对电解质渗透率增加等现象有关.通过qRT-PCR鉴定,前17个DEGs的表达模式与RNA-Seq分析结果一致,证实了RNA-Seq结果的可靠性,其中BnFd1(LOC106350097)和BnCP26(LOC106440450)均响应低温胁迫上调表达.BnFd1编码氨基酸产物是叶绿体上的铁氧还蛋白1(BnFd1),属于不稳定亲水蛋白,定位于叶绿体和细胞质中,存在一个信号肽,属于PLNO3136超家族,存在保守的Fd1结构域;BnCP26编码氨基酸产物是类囊体上叶绿素a-b结合蛋白CP26(BnCP26),属于稳定亲水蛋白,位于叶绿体中,无信号肽,属于叶绿素a_b结合超家族,存在保守的叶绿素A-B结合蛋白结构域.成功鉴定出2个甘蓝型油菜叶片低温应答基因BnFd1和BnCP26,与光合特性调控关系密切,物种间功能保守.
文献关键词：
甘蓝型油菜;低温胁迫;差异表达基因;BnFd1;BnCP26
中图分类号：
作者姓名：
金姣姣;刘自刚;米文博;徐明霞;邹娅;徐春梅;赵彩霞
作者机构：
陇东学院农林科技学院 陇东旱地作物种质改良及产业化协同创新中心 甘肃省旱地冬小麦种质创新与应用工程研究中心,庆阳 745000;甘肃省共建干旱生境作物学国家重点实验室 甘肃农业大学,兰州 730070;西藏自治区农牧科学院农业研究所,拉萨 860000
文献出处：
引用格式：
[1]金姣姣;刘自刚;米文博;徐明霞;邹娅;徐春梅;赵彩霞-.利用RNA-Seq鉴定调控甘蓝型油菜叶片光合特性的低温胁迫应答基因)[J].生物技术通报,2022(04):126-142
A类：
17NS,NF24,BnFd1,LOC106350097,BnCP26,LOC106440450,PLNO3136,Fd1,CP26
B类：
定调,甘蓝型油菜,菜叶,叶片光合特性,低温胁迫,胁迫应答,应答基因,耐寒,敏感材料,Illumina,HiSeqTM,叶片形态,光合参数,叶片超微结构,基因调控,表达模式,富集途径,光合作用途径,天线,特异表达基因,分子组成,生物学过程,幼苗,萎蔫,叶绿体,形态发生,类囊体,电解质渗透率,渗透率增加,加等,qRT,DEGs,铁氧还蛋白,定亲,亲水,细胞质,信号肽,超家族,上叶,叶绿素,结合蛋白,蛋白结构域,种间,差异表达基因
AB值：
0.246464
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