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典型文献
用以评估和校准人类生物学年龄的表观遗传学时钟的构建
文献摘要:
目的:构建适用于评估和校准人类生物学年龄的表观遗传学时钟模型。方法:于2019年7月1日至11月30日从广西壮族自治区长寿队列选取186名研究对象,于2020年10月1日至12月31日从解放军总医院第七医学中心体检人群选取124名研究对象。采用自制问卷收集人口学特征、家族疾病史等资料,通过体格检查测量对象的心率和血压,采集空腹外周静脉血,分别检测空腹血糖(FBG)、总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)和端粒长度,采用靶向甲基化位点测序检测EDARADD cg09809672、IPO8 cg19722847、NHLRC1 cg22736354、P2RX6 cg05442902和SCGN cg06493994基因位点的甲基化水平。排除DNA甲基化和端粒长度检测质量控制不合格的54名对象,最终对256名对象资料进行分析。分析不同年龄段甲基化水平变化情况,采用多重线性回归法构建生物学年龄预测模型,采用Kendal秩相关分析评价年龄差值[即(公历年龄-生物学年龄)]与端粒长度的相关性,比较各年龄组不同年龄差值对象的健康相关指标。结果:对象年龄的 M( Q1, Q3)为67(51,91)岁,其中女性166名(64.84%)。随年龄增加,基因位点甲基化水平分别呈下降(EDARADD cg09809672、IPO8 cg19722847和P2RX6 cg05442902)和上升趋势(NHLRC1 cg22736354和SCGN cg06493994)(均 P<0.05)。所构建的生物学年龄预测模型为: Y=-53.121×EDARADD cg09809672-137.564×IPO8 cg19722847+141.040×NHLRC1 cg22736354-67.893×P2RX6 cg05442902+149.547×SCGN cg06493994+4.592×sex+64.185( R2=0.86, P<0.001),式中 Y为生物学年龄,方程各项依次为5个基因位点甲基化水平、性别(男性=1,女性=2)和截距。年龄差值与端粒长度Kendall秩相关系数为0.731( P<0.001)。与年龄差值<0的对象相比,年龄差值≥0的对象未成年期收缩压较高[分别为(88.50±8.89)和(109.83±9.48)mmHg,1 mmHg=0.133 kPa],青壮年期TC较低[分别为(5.48±0.23)和(3.98±0.54)mmol/L],TG较低[分别为(3.51±0.32)和(3.41±0.20)mmol/L],中年期FBG较低[分别为(6.17±0.67)和(5.37±0.79)mmol/L],高龄老年期舒张压较高[分别为(76.99±6.78)和(83.97±9.36)mmHg](均 P<0.05)。 结论:所构建的表观遗传学时钟模型可用于评估和校准人类生物学年龄。
文献关键词:
DNA甲基化;时间生物学现象;生物学年龄;表观遗传学时钟;生物信息学分析
作者姓名:
倪晓琳;原慧萍;焦娟;王钊平;苏华斌;吕渊;庞国防;张为;孙亮;胡才友;杨泽
作者机构:
北京医院 国家老年医学中心 国家卫生健康委北京老年医学研究所 国家卫生健康委老年医学重点实验室 中国医学科学院老年医学研究院,北京 100730;中国解放军总医院第七医学中心检验科,北京 100700;广西壮族自治区江滨医院预防保健科,南宁 530021;广西壮族自治区江滨医院神经内科,南宁 530021
文献出处:
引用格式:
[1]倪晓琳;原慧萍;焦娟;王钊平;苏华斌;吕渊;庞国防;张为;孙亮;胡才友;杨泽-.用以评估和校准人类生物学年龄的表观遗传学时钟的构建)[J].中华医学杂志,2022(02):119-124
A类:
表观遗传学时钟,EDARADD,cg09809672,IPO8,cg19722847,NHLRC1,cg22736354,P2RX6,cg05442902,cg06493994,cg19722847+141,cg05442902+149,cg06493994+4,sex+64,未成年期,时间生物学现象
B类:
类生物,生物学年龄,时钟模型,广西壮族自治区,区长,长寿,解放军总医院,医学中心,心体,体检人群,卷收,人口学特征,疾病史,体格检查,外周静脉血,空腹血糖,FBG,总胆固醇,甘油三酯,高密度脂蛋白胆固醇,HDL,低密度脂蛋白胆固醇,LDL,端粒长度,甲基化位点,SCGN,基因位点,甲基化水平,长度检测,检测质量控制,不合格,不同年龄段,水平变化,多重线性回归,线性回归法,年龄预测,秩相关分析,年龄差,公历,历年,各年,年龄组,健康相关,Q1,Q3,截距,Kendall,秩相关系数,期收,收缩压,mmHg,kPa,青壮年,中年期,高龄老年,老年期,舒张压,生物信息学分析
AB值:
0.188099
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