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2014—2015年北京市批发市场肉类食品中沙门菌表型和基因组特征分析
文献摘要：
目的:分析北京批发市场肉类食品中沙门菌的表型和基因组特征。方法:对分离自北京市批发市场的336株肉类食品来源沙门菌，采用微量肉汤稀释法对25种抗菌药物进行耐药性测试，开展全基因组测序并使用SeqSero2、SISTR软件分析血清型和ST型，使用Abricate软件的CARD、VFDB模块预测菌株的耐药基因和毒力因子，使用沙门菌分子血清分型试剂盒和血清凝集法验证部分疑难菌株血清型。结果:336株沙门菌菌株对萘啶酸、氨苄西林的耐药率分别为62.5%（210/336）和55.1%（185/336），对替加环素、头孢西丁和碳青霉烯类抗菌药物均敏感；207株（61.6%，207/336）为多重耐药株，最高可同时耐受10类药物，最常见耐药谱为NAL-AMP-SAM。共检出24种血清型，主要型别为肠炎（34.5%，116/336）、德尔卑（17.3%，58/336）和印第安纳（10.4%，35/336）；共检出27种ST型，主要型别为ST11，ST型与血清型较为相符。氨基糖苷类、氟喹诺酮类、β-内酰胺类、磺胺类、四环素类耐药基因的携带率均超过48%，耐药基因预测与耐药表型结果一致性较高；共预测出122种毒力基因，其中74种携带率达100%。结论:北京市批发市场肉类食品中沙门菌中多重耐药比例较高、耐药谱复杂，血清型和ST型种类多样，耐药基因和毒力基因携带率较高，耐药表型和基因型较为一致。
文献关键词：
沙门菌属;血清分型;毒力因子类;全基因组测序;耐药基因
中图分类号：
作者姓名：
包轶伦;李辉;李孟寒;江涛;崔鑫楠;赫英英;于梦雅;余东敏;徐进;李凤琴;胡豫杰
作者机构：
国家食品安全风险评估中心 国家卫生健康委员会食品安全风险评估重点实验室，北京100021;北京工业大学环境与生命学部，北京 100124;北京农学院 食品科学与工程学院，北京 102206
文献出处：
引用格式：
[1]包轶伦;李辉;李孟寒;江涛;崔鑫楠;赫英英;于梦雅;余东敏;徐进;李凤琴;胡豫杰-.2014—2015年北京市批发市场肉类食品中沙门菌表型和基因组特征分析)[J].中华预防医学杂志,2022(06):815-823
A类：
SeqSero2,SISTR,Abricate
B类：
批发市场,肉类食品,中沙,基因组特征,微量肉汤稀释法,耐药性,全基因组测序,血清型,CARD,VFDB,耐药基因,血清分型,试剂盒,凝集法,疑难,萘啶酸,氨苄西林,耐药率,替加环素,头孢西丁,碳青霉烯类抗菌药物,多重耐药,耐药谱,NAL,AMP,SAM,共检出,型别,肠炎,印第安纳,ST11,氨基糖苷类,氟喹诺酮类,内酰胺,酰胺类,磺胺类,四环素类,携带率,耐药表型,结果一致性,预测出,毒力基因,药比,基因型,沙门菌属,毒力因子类
AB值：
0.260124
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