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广东HCV进化与注射吸毒者HCVNS5B区正向选择位点的分析研究
文献摘要：
目的 了解广东HCV进化与注射吸毒者(IDUs)HCVNS5B区正向位点的选择压力情况.方法 随机收集广东141(人)份HCV RNA阳性献血者和58(人)份HCV患者标本做HCV NS5B序列扩增,结合前期测序得到的2009年～2011年的献血者和IDUsHCVNS5B序列,用分子进化遗传学分析(MEGA)软件做同源性分析,贝叶斯进化分析抽样树(BEAST)软件包做进化分析,用Datamonkey在线软件包进化的混合效应模型(MEME)方法对IDUs分离的序列做选择压力分析,用进化分析软件Arlequin的Tajima和Fu中性检验分析种群扩张情况.结果 本组IDUs不同亚型内部同源性比较结果为:HCV-3b同源性最高(97％),其次为HCV-3a(96％),HCV-6a(95％)和HCV-1b(94％);HCV进化速率分析显示:HCV-1b的进化速率最快[2.17E-03替换数/位点/年(y/y/y)],其次为HCV-3b(2.12E-03 y/y/y),HCV-3a(1.58E-03 y/y/y)和 HCV-6a(1.28E-03 y/y/y);HCV 理论感染人数分析:1980 年～1990 年是 HCV-6a快速增长期,1990年～1995年是HCV-1b快速增长期,2000年～2007年是HCV-3a快速增长期;HCV群体遗传特征:HCV-1b、3a、3b和6a均经历了种群扩张,其中3a和3b最明显.HCV选择压力分析:IDUs NS5B序列中339个核苷酸有2个正向选择位点(第235和243位点),但此段基因的5个直接抗病毒药物(DAA)位点仅在第316位点发生了突变[突变率1.24％(14/1 130)].结论 广东地区HCV3b进化呈明显的种群扩张趋势,尤其在当地IDUs中的比例、同源性较高,应作为本地区HCV防治的重点.鉴于广东IDUsHCVNS5B基因片段的正向选择位点均非DAA结合位点,因此设想DAA对这些患者有较好的疗效.
文献关键词：
丙型肝炎病毒;HCV进化;HCV选择压力;注射吸毒者;正向选择位点;直接抗病毒药物;广东
中图分类号：
作者姓名：
王敏;许茹;廖峭;钟惠珊;黄杰庭;杜荣松;单振刚;戎霞;付涌水
作者机构：
广州血液中心广州市血液安全重点实验室,广东广州510095
文献出处：
引用格式：
[1]王敏;许茹;廖峭;钟惠珊;黄杰庭;杜荣松;单振刚;戎霞;付涌水-.广东HCV进化与注射吸毒者HCVNS5B区正向选择位点的分析研究)[J].中国输血杂志,2022(06):597-601
A类：
HCVNS5B,IDUs,IDUsHCVNS5B,58E,28E,HCV3b
B类：
注射吸毒者,正向选择位点,选择压力,机收,献血者,分子进化,遗传学分析,MEGA,同源性分析,贝叶斯进化分析,BEAST,软件包,Datamonkey,混合效应模型,MEME,压力分析,Arlequin,Tajima,Fu,中性检验,检验分析,种群扩张,不同亚型,同源性比较,3a,6a,1b,进化速率,17E,12E,增长期,群体遗传,遗传特征,此段,直接抗病毒药物,DAA,突变率,广东地区,应作,结合位点,丙型肝炎病毒
AB值：
0.223716
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