典型文献
颅内动脉瘤破裂关键基因的生信分析
文献摘要:
目的 探讨颅内动脉瘤破裂的关键基因.方法 采用生信分析方法,GEO数据库下载数据集GSE13353、GSE15629、GSE54083,R语言筛选差异表达基因(DEG),WGCNA算法分析动脉瘤破裂关键基因,采用GO和KEGG分析关键基因的生物学功能,GSEA软件进行基因富集分析.应用GSE122897数据集进行验证.结果 共筛选出49个DEG,其中28个上调,21个下调.WGCNA算法、GO和KEGG分析结果显示,颅内动脉瘤破裂主要与炎症和免疫反应有关.枢纽基因和关键基因筛选显示,VNN2和CXCR4在颅内动脉瘤破裂过程中起重要作用.结论 我们使用WGCNA的3个GEO数据集构建破裂和未破裂动脉瘤的共表达网络,筛选出介导颅内动脉瘤破裂的关键基因,这些关键基因与炎症和免疫反应密切相关.这提示炎症和免疫反应可能在颅内动脉瘤破裂过程中起重要作用.
文献关键词:
颅内动脉瘤;WGCNA算法;生物信息学;基因表达
中图分类号:
作者姓名:
武朋磊;吴赞;孟繁成;杨廷舰
作者机构:
261000山东潍坊,潍坊医学院附属医院神经外科
文献出处:
引用格式:
[1]武朋磊;吴赞;孟繁成;杨廷舰-.颅内动脉瘤破裂关键基因的生信分析)[J].中国临床神经外科杂志,2022(02):95-99,103
A类:
GSE13353,GSE15629,GSE54083,GSE122897,VNN2
B类:
颅内动脉瘤破裂,生信分析,GEO,下载数据,差异表达基因,DEG,WGCNA,算法分析,生物学功能,GSEA,基因富集分析,免疫反应,枢纽基因,关键基因筛选,CXCR4,破裂过程,数据集构建,未破裂动脉瘤,共表达网络
AB值:
0.175468
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