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典型文献
基于网络药理学和分子对接探讨活络效灵丹治疗骨关节炎的作用机制
文献摘要:
目的 基于网络药理学和分子对接探讨活络效灵丹治疗骨关节炎的作用机制.方法 利用TCMSP数据分析平台和文献检索获取活络效灵丹的活性成分,筛选出口服生物利用度(OB)≥30%且类药性(DL)≥0.18的成分作为潜在活性成分.通过Uniprot数据库预测潜在活性成分对应的基因.查询GeneCards、OMIM、TTD、DrugBank、Pharmgkb等数据库获得骨关节炎的相关靶点且进行去重合并.应用Cytoscape 3.8.2软件建立可视化网络图,根据度值选定核心药物潜在活性成分.借助String数据库分析获取药物与疾病的蛋白相互作用(PPI)网络,凭借Cytoscape3.8.2软件对该网络采取拓扑学分析,对潜在靶点进行GO富集分析和KEGG富集分析.使用SYBYL-X2.0软件进行分子对接验证.结果 活络效灵丹有效活性成分共120种、作用靶点201个,骨关节炎相关靶点1675个;经PPI网络及拓扑结构分析得到184个节点和282条边;木犀草素、槲皮素等为活络效灵丹的主要活性成分.在生物学进程中,靶点主要通过细胞对化学应激的反应等路径发挥作用;在分子功能上,靶点主要影响核受体活性等方面.分子对接结果显示,MAPK1、MAPK14、RELA、JUN作为靶点可与木犀草素、槲皮素等稳定对接.结论 活络效灵丹可能通过调控多个靶点及相关信号通路,影响细胞凋亡、软骨基质降解、抑制关节炎及骨损伤,从而延缓骨关节炎的发展进程.
文献关键词:
活络效灵丹;骨关节炎;网络药理学;分子对接;木犀草素;槲皮素
作者姓名:
李沿鑫;王爱国;陆贲琪;贾易臻;赵允;陆军
作者机构:
天津中医药大学 研究生院,天津 301617;天津市中医药研究院附属医院,天津 300120
文献出处:
引用格式:
[1]李沿鑫;王爱国;陆贲琪;贾易臻;赵允;陆军-.基于网络药理学和分子对接探讨活络效灵丹治疗骨关节炎的作用机制)[J].现代药物与临床,2022(04):708-718
A类:
B类:
网络药理学,分子对接,活络效灵丹,骨关节炎,TCMSP,分析平台,文献检索,口服生物利用度,OB,类药性,DL,分作,Uniprot,GeneCards,OMIM,TTD,DrugBank,Pharmgkb,可视化网络,网络图,核心药物,String,数据库分析,取药,蛋白相互作用,PPI,Cytoscape3,拓扑学,潜在靶点,富集分析,SYBYL,X2,作用靶点,拓扑结构,木犀草素,槲皮素,主要活性成分,过细,核受体,MAPK14,RELA,JUN,软骨基质,骨损伤,而延
AB值:
0.294341
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