典型文献
一种基于胶囊网络外膜蛋白拓扑结构预测方法
文献摘要:
目的 采用计算手段探索在当前外膜蛋白小样本的条件下提升外膜蛋白拓扑结构预测精度的深度学习方法.方法 首先,选取和构建适用于预测外膜蛋白拓扑结构的数据集;其次,经特征筛选和对比实验确定模型的最优输入;再次,构建和优化基于胶囊网络的拓扑结构预测模型TopOMP-capsnet;最后,通过对比同类方法评估和验证模型性能.结果 和结论拓扑结构预测模型TopOMP-capsnet与同类方法相比,性能有所提升,证明深度学习技术能够在有限样本条件下识别相应序列模式,有助于外膜蛋白结构和功能的大规模分类及筛选.创新之处拓扑结构预测模型TopOMP-capsnet的三态预测准确率(Q3)达到87.7%,优于传统机器学习方法.
文献关键词:
胶囊网络;外膜蛋白;拓扑结构;深度学习
中图分类号:
作者姓名:
宋世龙;赵雨桐;王茜;王晗
作者机构:
东北师范大学信息科学与技术学院计算生物研究所,吉林长春 130117
文献出处:
引用格式:
[1]宋世龙;赵雨桐;王茜;王晗-.一种基于胶囊网络外膜蛋白拓扑结构预测方法)[J].生物医学工程学进展,2022(04):207-218
A类:
TopOMP,capsnet
B类:
胶囊网络,外膜蛋白,拓扑结构,结构预测,小样本,深度学习方法,特征筛选,定模,方法评估,验证模型,模型性能,深度学习技术,有限样本,样本条件,序列模式,蛋白结构,结构和功能,创新之处,三态,预测准确率,Q3,机器学习方法
AB值:
0.249512
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