典型文献
利用BSA-Seq方法定位一个水稻早衰相关基因OsBRCA1
文献摘要：
[目的]水稻早衰突变体是研究水稻衰老机制的良好载体.定位和克隆水稻早衰相关基因,有助于理解水稻早衰的遗传规律和分子机制,为相关基因的作用机制研究奠定基础.[方法]用EMS化学诱变处理粳稻云引,获得一个稳定遗传的早衰突变体w14,与日本晴杂交构建F2分离群体,并在群体中各选择100个隐性单株和显性单株的DNA等量混合,利用BSA-seq分析两个DNA池之间的差异位点,定位水稻早衰相关基因.[结果]突变体w14的早衰表型受单隐性基因控制,对两个DNA池测序结果进行单基因定位和突变基因的鉴定,发现单基因主峰位于Chr3,候选区间为Chr3:27.5～29.5 Mb,进一步在目标区域内找到2个符合条件的候选因果变异.[结论]候选基因LOC_Os03g49210突变位点是由野生型的C突变为T,且该突变位于候选基因的第2外显子上,属于错义突变,造成了该基因编码的第20个氨基酸由T(苏氨酸)变成I(异亮氨酸),从而可能导致了基因功能的改变,因此,将该基因定为本研究的候选基因,因与人类BRCA1同源,命名为OsBRCA1.
文献关键词：
水稻;突变体;早衰;基因克隆;BSA-seq
中图分类号：
作者姓名：
蒋家焕;朱永生;陈丽萍;郑燕梅;蔡秋华;谢华安;王爱荣;张建福
作者机构：
福建省农业科学院水稻研究所/农业农村部华南杂交水稻种质创新与分子育种重点实验室/福州(国家)水稻改良分中心/福建省作物分子育种工程实验室/福建省水稻分子育种重点实验室,福建 福州 350003;福建农林大学植物保护学院,福建 福州 350002
文献出处：
引用格式：
[1]蒋家焕;朱永生;陈丽萍;郑燕梅;蔡秋华;谢华安;王爱荣;张建福-.利用BSA-Seq方法定位一个水稻早衰相关基因OsBRCA1)[J].福建农业学报,2022(02):131-137
A类：
OsBRCA1,w14,Os03g49210
B类：
BSA,Seq,水稻,早衰突变体,衰老机制,遗传规律,EMS,化学诱变,粳稻,稳定遗传,F2,分离群体,单株,等量,seq,异位,单基因,基因定位,突变基因,主峰,Chr3,候选区间,Mb,目标区域,符合条件,候选基因,LOC,突变位点,野生型,外显子,错义突变,基因编码,苏氨酸,异亮氨酸,基因功能,基因克隆
AB值：
0.320606
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