典型文献
眶棘鲈属鱼类DNA条形码及分子系统进化研究
文献摘要:
为在分子层面分析我国眶棘鲈属(Scolopsis)鱼类系统进化关系,同时探讨COⅠ基因作为DNA条形码在眶棘鲈属鱼类物种鉴定的适用性.本研究对采集的9种眶棘鲈COⅠ基因部分序列进行PCR扩增及测序,结合Gen-Bank下载的5种眶棘鲈COⅠ基因序列共同分析.结果表明,14种眶棘鲈的种内平均遗传距离为:0.0025;种间平均遗传距离为0.1794,种间距离是种内的71.76倍.在分子系统进化树上,14种眶棘鲈主要形成3个分支:分支Ⅰ包含4种眶棘鲈,这4种眶棘鲈眶下骨均具大棘,与形态学分类结果一致;分支Ⅱ包含4种眶棘鲈,分支Ⅲ包含6种眶棘鲈,但进化树部分节点的支持率相对较低,表明COⅠ基因在眶棘鲈属鱼类中可作为有效的DNA条形码基因以区分物种,但不一定适合用于分子系统进化分析.另外,部分资料中认为是同种异名的条纹眶棘鲈(Scolopsis taeniopterus)与双斑眶棘鲈(Scolopsis bimaculata)、单带眶棘鲈(Scolopsis monogramma),彼氏眶棘鲈(Scolopsis affinis)与黄带眶棘鲈(Scolopsis aurata),本研究COⅠ遗传距离分别为0.160、0.118和0.122,均远大于Hebert推荐的区分不同物种的最小遗传距离2%,各自应分别为独立物种.
文献关键词:
眶棘鲈属;COⅠ基因;系统进化
中图分类号:
作者姓名:
陈厚桦;陈震翰;陈玉佩;叶嘉文;李培源;林蠡;梁日深
作者机构:
仲恺农业工程学院动物科技学院,广东广州510225;广东省水环境与水产品安全工程技术研究中心,广东广州510225;广州市水产病害与水禽养殖重点实验室,广东广州510225
文献出处:
引用格式:
[1]陈厚桦;陈震翰;陈玉佩;叶嘉文;李培源;林蠡;梁日深-.眶棘鲈属鱼类DNA条形码及分子系统进化研究)[J].仲恺农业工程学院学报,2022(02):20-25
A类:
眶棘鲈属,Scolopsis,种间距离,taeniopterus,bimaculata,monogramma,Hebert
B类:
鱼类,条形码,进化关系,物种鉴定,Gen,Bank,下载,基因序列,种内,内平,遗传距离,系统进化树,树上,形态学分类,分节,支持率,系统进化分析,异名,条纹,affinis,aurata,远大于,自应
AB值:
0.230308
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