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典型文献
基于16sRNA扩增子测序分析患烂皮病棘胸蛙皮肤的细菌多样性
文献摘要:
烂皮病是棘胸蛙人工养殖过程中的常见疾病,主要表现为细菌感染而引起的蛙表皮溃烂.该病传染性强,死亡率高,严重影响棘胸蛙养殖的经济效益.解析溃烂皮肤中的细菌多样性,对于棘胸蛙烂皮病的诊断以及防治有着重要意义.因此,收集了患烂皮病棘胸蛙的健康和溃烂部位的皮肤样本,采用细菌16sRNA片段高通量测序和生物信息学分析手段,挖掘烂皮病棘胸蛙的溃烂皮肤中的细菌结构特征.结果显示,溃烂皮肤中细菌的丰度和多样性均显著低于健康皮肤.在门分类水平上,溃烂皮肤的优势菌门是变形菌门Proteobacteria,而健康皮肤的优势菌门是蓝细菌门/叶绿体Cyanobacteria Chloroplast、变形菌门Proteobacteria、厚壁菌门Firmicutes、拟杆菌门Bacteroidetes、放线菌门Actinobacteria.在属分类水平上,溃烂皮肤的优势菌属为不动杆菌属Acinetobacter,健康皮肤中的优势菌属为链形植物属Streptophyta、不动杆菌属.不动杆菌属虽然为健康皮肤和患病皮肤的共有属,但是溃烂皮肤中的不动杆菌属的含量显著高于健康皮肤.研究结果解析了患烂皮病棘胸蛙的皮肤中可能的致病细菌,对于棘胸蛙养殖过程中的病害防治有重要的指导意义.
文献关键词:
棘胸蛙;烂皮病;皮肤;高通量测序;菌群结构
作者姓名:
张雪萍;徐莉;符宏高;陈美玲;黄其锻;陆永树;耿宝荣;陈友铃;黄镇
作者机构:
福建师范大学生命科学学院/福建省发育与神经生物学重点实验室,福建 福州 350117;福建省健丰生物科技有限公司 ,福建 泉州 362500;福建省石冻王生物技术研发中心有限公司 ,福建 泉州 362500;福建省南平市政和县天富盈农业专业合作社 ,福建 南平 353602
文献出处:
引用格式:
[1]张雪萍;徐莉;符宏高;陈美玲;黄其锻;陆永树;耿宝荣;陈友铃;黄镇-.基于16sRNA扩增子测序分析患烂皮病棘胸蛙皮肤的细菌多样性)[J].福建农业科技,2022(11):1-9
A类:
B类:
16sRNA,扩增子测序,测序分析,烂皮病,棘胸蛙,细菌多样性,蛙人,人工养殖,常见疾病,细菌感染,溃烂,病传,传染性,生物信息学分析,分析手段,细菌结构,优势菌,变形菌门,Proteobacteria,蓝细菌,叶绿体,Cyanobacteria,Chloroplast,厚壁菌门,Firmicutes,拟杆菌门,Bacteroidetes,放线菌,Actinobacteria,不动杆菌属,Acinetobacter,Streptophyta,病害防治,菌群结构
AB值:
0.290621
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