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典型文献
基于生物信息学的肝细胞癌预后模型的构建
文献摘要:
为探讨肿瘤突变负荷(tumor mutation burden,TMB)对肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)患者预后的影响,从the Cancer Genome Atlas数据库下载357例HCC样本进行生物信息学分析.结果显示:在HCC患者中,C>T变异、错义突变及TP53基因突变频率最高;TMB与患者预后呈负相关(P<0.05).功能分析表明,差异基因富集于细胞外基质组织形成和硫化合物代谢途径(P<0.05).基于SFRP4、IL7R、FBLN2、COLEC10和CHGA基因,构建了HCC预后预测模型.结果表明,高危组患者1年、3年和5年预后较差(P<0.001).
文献关键词:
肝细胞癌;肿瘤突变负荷;分子预后模型;生物信息学
作者姓名:
李青玲;李树德;卫小娟;黄映光;李思熳
作者机构:
昆明医科大学 基础医学院 生物化学与分子生物学系,云南 昆明650500;中国科学院 昆明动物研究所,云南 昆明650201;云南省第一人民医院 普外一科,云南 昆明650034
文献出处:
引用格式:
[1]李青玲;李树德;卫小娟;黄映光;李思熳-.基于生物信息学的肝细胞癌预后模型的构建)[J].昆明学院学报,2022(06):64-72
A类:
B类:
肝细胞癌,肿瘤突变负荷,tumor,mutation,burden,TMB,Hepatocellular,carcinoma,HCC,Cancer,Genome,Atlas,下载,生物信息学分析,错义突变,TP53,基因突变,突变频率,功能分析,差异基因,基因富集,细胞外基质,组织形成,硫化合物,代谢途径,SFRP4,IL7R,FBLN2,COLEC10,CHGA,预后预测模型,分子预后模型
AB值:
0.478072
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