典型文献
基于16S rRNA测序对2型糖尿病患者肠道菌群特征的分析
文献摘要：
目的 分析比较2型糖尿病患者(T2D)与正常人群肠道菌群结构、丰度及多样性的差异.方法 收集30例临床粪便样本(健康样本15例为研究组,2型糖尿病病例样本15例为对照组),应用Illumina MiSeq高通量测序技术进行Alpha、Beta多样性分析,比较研究组和对照组肠道菌群丰富度和多样性以及两组间的肠道菌群差异.采用Tax4 Fun软件进行差异菌群功能预测.结果 研究组和对照组OTU共有1565个,其中两组共有OTU为767个.与对照组比较,研究组肠道菌群α多样性下降;Unweighted Unifrac距离显著降低,差异有统计学意义(P<0.05),β多样性存在差异.在门水平上,研究组中厚壁菌门(Fimicutes)、变形杆菌门(Proteobacteria)的相对丰度明显高于对照组,而拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线杆菌门(Actinobacteria)、疣微菌门(Verrucomicrobiota)相对丰度低于对照组.在属水平上,研究组克雷伯氏菌(Klebsiella)、普拉梭菌(Faecalibacterium)的相对丰度明显高于对照组,狄氏副拟杆菌(Parabacteroides)、普雷沃菌(Prevotella)、艾克曼菌(Akkermansia)、双歧杆菌(Bifidobacterium)的相对丰度明显低于对照组.线性判别效应(LEfSe)分析发现糖尿病可选择克雷伯菌属作为关键的生物标志物,对照组可选择双歧杆菌属、艾克曼菌属、普雷沃氏菌属、狄氏副拟杆菌属作为关键的生物标志物.通过差异菌群进行KEGG代谢通路分析发现组间25条KEGG代谢通路存在显著差异,研究组的能量代谢和糖代谢等代谢途径均有上调.结论 研究组和对照组肠道菌群丰度上具有显著差异,可作为2型糖尿病诊断和治疗靶标的候选标志菌群.
文献关键词：
肠道菌群;2型糖尿病;16S rRNA测序;特征分析
中图分类号：
作者姓名：
何倩;杨建;陈冰婷;谭惠文;伊丽则热·艾拜杜拉;马晓丽
作者机构：
新疆医科大学药学院,乌鲁木齐830017;新疆医科大学附属中医医院药学部,乌鲁木齐830002;新疆天然药物活性组分与释药技术重点实验室,乌鲁木齐830000
文献出处：
引用格式：
[1]何倩;杨建;陈冰婷;谭惠文;伊丽则热·艾拜杜拉;马晓丽-.基于16S rRNA测序对2型糖尿病患者肠道菌群特征的分析)[J].新疆医科大学学报,2022(11):1262-1268
A类：
Tax4,Fimicutes
B类：
16S,rRNA,糖尿病患者,肠道菌群特征,T2D,正常人,肠道菌群结构,粪便样本,Illumina,MiSeq,高通量测序技术,Alpha,Beta,多样性分析,丰富度,菌群差异,Fun,菌群功能,功能预测,OTU,Unweighted,Unifrac,厚壁菌门,变形杆菌,Proteobacteria,相对丰度,拟杆菌门,Bacteroidetes,放线杆菌,Actinobacteria,Verrucomicrobiota,克雷伯氏菌,Klebsiella,普拉梭菌,Faecalibacterium,Parabacteroides,普雷沃菌,Prevotella,艾克曼,Akkermansia,Bifidobacterium,线性判别,LEfSe,克雷伯菌,生物标志物,双歧杆菌属,普雷沃氏菌,拟杆菌属,代谢通路分析,能量代谢,糖代谢,代谢途径,菌群丰度,糖尿病诊断,诊断和治疗,靶标
AB值：
0.383514
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