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16S rRNA在常见致病分枝杆菌菌种鉴定中的应用
文献摘要：
目的 通过分析16 S rRNA在不同分枝杆菌中的异同,探讨测序技术有关的实验和数据处理问题.方法 采用Mega6.0软件对34株非结核分枝杆菌分离株及美国国家生物技术信息中心(NCBI)现有的55株常见致病分枝杆菌和1株诺卡菌的16S rRNA序列进行比对分析,并用Maximum Likelihood法构建进化树,最后用DNASTAR/MegAlign程序计算种间及种内相似性.结果 PCR扩增后获得长度约为1500 bp的目的片段,与下载获得的16S rRNA序列进行比对分析并剪齐后保留1248 bp,16S rRNA可以将常见致病性分枝杆菌分为18群,种间相似性为91.5％～100.0％,种内相似性为99.0％～100.0％.结论 16S rRNA种内保守性高且具有较好的种特异性,除了龟分枝杆菌和脓肿分枝杆菌、鸟分枝杆菌和胞内分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌和胃分枝杆菌、溃疡分枝杆菌和海鱼分枝杆菌、人型分枝杆菌和牛型分枝杆菌不能分开外,16 S rRNA可将常见致病性分枝杆菌各种分开,可作为一种较好的鉴定分枝杆菌的方法.
文献关键词：
16S rRNA;分枝杆菌;鉴定
中图分类号：
作者姓名：
纪凌云;李马超;蒋毅;赵秀芹;万康林;王琳琳;刘海灿
作者机构：
同济大学附属东方医院南院检验科,上海 200120;中国疾病预防控制中心传染病预防控制所/传染病预防控制国家重点实验室,北京 102206;同济大学附属东方医院门诊护理部,上海 200120
文献出处：
引用格式：
[1]纪凌云;李马超;蒋毅;赵秀芹;万康林;王琳琳;刘海灿-.16S rRNA在常见致病分枝杆菌菌种鉴定中的应用)[J].检验医学与临床,2022(11):1467-1471
A类：
Mega6,剪齐,海鱼分枝杆菌
B类：
16S,rRNA,菌种鉴定,非结核分枝杆菌,分离株,生物技术,信息中心,NCBI,诺卡菌,比对分析,Maximum,Likelihood,进化树,DNASTAR,MegAlign,种间,种内,bp,下载,致病性,保守性,龟分枝杆菌,脓肿分枝杆菌,鸟分枝杆菌,胞内分枝杆菌,堪萨斯分枝杆菌,和胃,和牛,开外
AB值：
0.283332
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