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MALDI-TOF MS用于耐碳青霉烯类阴沟肠杆菌的同源性分析
文献摘要:
目的 以脉冲场凝胶电泳(PFGE)为金标准,评价临床实验室应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对耐碳青霉烯类阴沟肠杆菌(CRECL)进行同源性分析的可行性.方法 收集2018年8月至2019年6月从粤北人民医院住院患者中分离的非重复CRECL菌株10株,编号YG1~YG10.利用Biotyper 3.1软件对CRECL蛋白图谱进行主成分分析(PCA)和核心图谱(MSP)聚类分析,同时进行PFGE同源性分析,并将2种质谱分型方法所得的结果与金标准对比分析.编号为YG10的菌株无法进行PFGE分型被排除.结果 PFGE同源性分析结果与MALDI-TOF MS同源性分析结果有较大差异,PFGE分型结果显示9株CRECL为不同型;MSP聚类分析将9株CRECL分为3型(A型4株,B型4株,C型1株),其中A型的YG3和YG7,以及B型的YG2和YG5水平线距离均为0;PCA聚类分析同样将9株CRECL分为3型(A型2株,B型4株,C型3株).2种质谱聚类分析都将YG3和YG6分到同一型中,而YG2、YG4及YG8分到另外的同一型中.结论 MALDI-TOF MS有一定的同源性分型能力,但与PFGE同源性分型结果相比较,MAL-DI-TOF MS的2种同源性分型结果都还有待进一步研究.
文献关键词:
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱;脉冲场凝胶电泳;耐碳青霉烯类阴沟肠杆菌;同源性分析
中图分类号:
作者姓名:
张河林;张敏;赵秀林;赵平森
作者机构:
粤北人民医院检验科,广东韶关512026;广东药科大学临床医学院,广东广州510030;粤北人民医院胃肠外科,广东韶关512026
文献出处:
引用格式:
[1]张河林;张敏;赵秀林;赵平森-.MALDI-TOF MS用于耐碳青霉烯类阴沟肠杆菌的同源性分析)[J].检验医学与临床,2022(08):1014-1017
A类:
YG1,YG3,YG7,YG2,YG5,YG4
B类:
MALDI,TOF,耐碳青霉烯类阴沟肠杆菌,同源性分析,脉冲场凝胶电泳,PFGE,金标准,临床实验室,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱,CRECL,行同,粤北,北人,医院住院,住院患者,编号,YG10,Biotyper,MSP,分型方法,标准对比,水平线,谱聚类,YG6,分到,YG8
AB值:
0.174098
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