典型文献
肝细胞癌中EZH2基因相关的表观遗传调控机制
文献摘要：
目的 结合肝细胞癌公共数据分析与生物实验,初步探索肝细胞癌中EZH2基因的表观遗传调控机制.方法 使用TCGA公共数据分析EZH2基因表达与肝细胞癌进展和预后之间的关系.随后,使用ATP细胞活性检测法、结晶紫法分析EZH2抑制剂GSK343对肝细胞癌细胞系HepG2细胞活性和增殖的影响.之后,分析TCGA公共数据样本中EZH2高表达组和低表达组之间的差异表达基因.其后,使用ENCODE中的ChIP-seq公共数据分析EZH2下游靶基因转录起始位点上的组蛋白修饰特征.最后,用RT-qPCR检测受到EZH2调控的下游靶基因的基因表达.结果 EZH2基因表达与肝细胞癌1～3期的病程进展显著相关(P<0.05);生存分析表明EZH2基因高表达与肝细胞癌预后不良显著相关(P<0.05);EZH2抑制剂能够显著抑制肝细胞癌细胞系HepG2的体外细胞活力和增殖能力(P<0.05);EZH2结合的基因转录起始位点上富集组蛋白修饰H3K27me3;163个基因在其转录起始位点附近存在EZH2结合信号,同时这些基因也在EZH2高表达组和低表达组之间显著差异表达;实验验证ADRA1A是EZH2的下游靶基因.结论 在肝细胞癌中EZH2基因可以通过表观遗传调控影响其下游靶基因的表达.
文献关键词：
肝细胞癌;zeste同源蛋白2增强子;表观遗传调控
中图分类号：
作者姓名：
赵钰珊;冀梦蝶;董昱诚;郭鑫;宋博渊;陈阳
作者机构：
中国医学科学院基础医学研究所 北京协和医学院基础学院 生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室,北京100005
文献出处：
引用格式：
[1]赵钰珊;冀梦蝶;董昱诚;郭鑫;宋博渊;陈阳-.肝细胞癌中EZH2基因相关的表观遗传调控机制)[J].基础医学与临床,2022(06):864-870
A类：
B类：
EZH2,表观遗传调控,调控机制,公共数据,生物实验,初步探索,TCGA,ATP,细胞活性,活性检测,检测法,结晶紫,GSK343,肝细胞癌细胞,细胞系,HepG2,低表达,差异表达基因,ENCODE,ChIP,seq,靶基因,基因转录,转录起始位点,组蛋白修饰,qPCR,病程进展,生存分析,预后不良,体外细胞,细胞活力,H3K27me3,ADRA1A,zeste,同源蛋白,增强子
AB值：
0.251855
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