典型文献
不同运动方式对小鼠心脏重塑过程中基因表达的生物信息学分析
文献摘要：
目的:探究不同运动方式对心脏重塑过程中基因表达影响,以期揭示其潜在机制.方法:在基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中搜索运动心脏重塑相关数据集,筛选条件为运动干预时间一样、研究对象的种属及性别相同.下载符合条件的数据集,将数据标准化后进行分析并得到差异表达基因,对差异基因进行交互分析,以查看共同差异基因.然后对差异表达基因进行GO和KEGG富集分析.最后对差异表达基因进行网络互作分析和转录因子富集分析.结果:本研究得到3周游泳和3周自由转轮运动后小鼠心肌的微阵列数据集,分析后发现游泳运动后小鼠心肌中的差异基因有275个(上调129个,下调146个),自由转轮运动后小鼠心肌中的差异基因有856个(上调559个,下调297个),两者共同上调基因有8个,共同下调基因有10个.游泳运动后小鼠心肌差异基因功能富集在血管生成和发育,网络互作关键基因为Agt和Pik3r2;而自由转轮运动后小鼠心肌差异基因功能富集在病毒反应,网络互作关键基因为Mad2l1、Spc25、Cdk1、Mcm6、Tipin、Cks2和Cd68.这些基因参与细胞周期,与细胞分裂和生长有关.两者差异基因的转录因子富集分析结果也不同,游泳运动富集到的转录因子为predrem_nrMotif2039、predrem_nrMotif1919和TBP,而自由转轮运动富集到的转录因子为jaspar_MA0050.2、IRF1、IRF7.结论:通过对GEO数据进行生物信息学分析,本研究发现游泳运动和自由转轮运动两种运动方式在诱导小鼠心脏重塑过程中差异基因的数量不同、共同差异基因少、差异基因功能富集及转录因子富集结果都不同,因此,这两种运动诱导的生理性心肌重塑的分子机制也可能不同.
文献关键词：
运动;心脏重塑;微阵列;转录因子
中图分类号：
作者姓名：
饶志坚;郑莉芳;于涛;史仍飞
作者机构：
上海师范大学体育学院 上海 200234;国家体育总局体育科学研究所 北京 100061;上海大学体育学院 上海 200444;上海体育学院运动科学学院 上海 200438
文献出处：
引用格式：
[1]饶志坚;郑莉芳;于涛;史仍飞-.不同运动方式对小鼠心脏重塑过程中基因表达的生物信息学分析)[J].中国运动医学杂志,2022(03):201-217
A类：
Pik3r2,Mad2l1,Spc25,Mcm6,Tipin,Cks2,Cd68,predrem,nrMotif2039,nrMotif1919,jaspar,MA0050
B类：
不同运动方式,心脏重塑,生物信息学分析,潜在机制,基因表达数据库,gene,expression,omnibus,GEO,动心,运动干预,种属,下载,符合条件,数据标准化,差异表达基因,差异基因,交互分析,查看,富集分析,互作分析,周游,转轮,微阵列数据,游泳运动,同上,同下,基因功能,功能富集,血管生成,关键基因,Agt,Cdk1,细胞周期,细胞分裂,TBP,IRF1,IRF7,集结,生理性,心肌重塑
AB值：
0.243936
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
