典型文献
成年商品猪肠道可培养核心菌群的结构与组成分析
文献摘要：
为探明成年商品猪肠道可培养核心菌群的结构与分布,该研究从3头健康成年商品猪的6个肠段17个肠节段中通过普通培养的方法,共分离筛选出355株可培养核心菌,并进行16S rDNA全序列扩增、测序,通过Mothur软件的OTU聚类及NCBI的在线比对进行分析.结果显示,成年猪肠道中的可培养核心菌群绝大部分属于Proteobacteria和Firmicutes两菌门,其中Escherichia、Bacillus、Proteus 3个菌属丰度最高,占全部检出率的80％;Escherichia coli、Bacillusamyloliquefaciens、Shigella、Bacillus和Proteusmirabilis 5个菌种是广泛分布于商品猪肠道各肠段的共有菌种.菌群的OTU聚类分析结果与NCBI在线比对结果存在明显差别,说明当前单纯的OTU聚类分析并不能完全取代菌群基因数据库的直接比对.
文献关键词：
肠道菌群;成年猪;多样性分析;可培养菌;菌群结构;聚类分析
中图分类号：
作者姓名：
田野;蔡淳理;杨大容;李慧;刘宝生
作者机构：
江西农业大学 动物科学技术学院,江西 南昌 330045;四川农业大学 动物医学院,四川 成都 611130;江西农业大学 兽药研究所,江西 南昌 330045
文献出处：
引用格式：
[1]田野;蔡淳理;杨大容;李慧;刘宝生-.成年商品猪肠道可培养核心菌群的结构与组成分析)[J].家畜生态学报,2022(10):36-44
A类：
Bacillusamyloliquefaciens,Proteusmirabilis
B类：
商品猪,猪肠,核心菌群,结构与组成,组成分析,肠段,节段,分离筛选,16S,rDNA,全序,Mothur,OTU,NCBI,成年猪,绝大部分,分属,Proteobacteria,Firmicutes,Escherichia,coli,Shigella,菌种,基因数据库,肠道菌群,多样性分析,可培养菌,菌群结构
AB值：
0.326828
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