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典型文献
线粒体基因和核基因揭示自然屏障和第四纪更新世气候振荡影响双斑乙蠊谱系地理格局
文献摘要:
[目的]明确双斑乙蠊Sigmella biguttata种群间遗传分化程度,并揭示该种地理分布格局成因.[方法]PCR扩增双斑乙蠊19个地理种群284头个体的线粒体基因COⅠ,COⅡ和ND1以及核基因ITS的序列;使用MEGA v.7.0,DnaSP v.5.0和Arlequin v.3.5软件分析双斑乙蠊地理种群的遗传多样性和遗传分化;采用中性检验和错配分布分析方法检测种群历史动态;采用最大似然法(maximum likelihood,ML)和贝叶斯法(Bayesian inference,BI)构建系统发育树,并利用中介邻接网络算法构建单倍型网络图;基于线粒体基因COI替换率推断双斑乙蠊各种群的分化时间.[结果]双斑乙蠊地理种群呈现出较高的遗传多样性(Hd=0.98835,π=0.02777).ML和BI系统发育树的拓扑结构一致且具有较高的支持率,显示双斑乙蠊所有地理种群分为3个支系8个组,表现出明显的谱系地理结构,这与SAMOVA得到的遗传结构分析结果一致.单倍型网络图显示不同地理种群间无共享单倍型.遗传分化和基因流(Nm)分析显示,种群间的Fst值大于0.25,最大Nm值小于1.种群历史动态检测结果表明,Group 2,Group 4,Group 6和Group 7经历了种群扩张,扩张时间均在末次间冰期,而Group 1,Group 3,Group 5和Group 8未发生种群扩张.双斑乙蠊各支系及各组的分化时间在中更新世期(0.5391-0.1544 Ma).[结论]双斑乙蠊不同种群间存在显著的遗传分化.温暖潮湿的气候环境有助于双斑乙蠊种群发生扩张,种群的遗传结构和地理分布格局受到地理屏障和第四纪更新世气候振荡的影响.
文献关键词:
双斑乙蠊;谱系地理学;种群历史动态;遗传分化;地理分布格局
作者姓名:
陈蓉;牛力康;端木浩楠;王宗庆;车艳丽
作者机构:
西南大学植物保护学院昆虫研究所,重庆400715
文献出处:
引用格式:
[1]陈蓉;牛力康;端木浩楠;王宗庆;车艳丽-.线粒体基因和核基因揭示自然屏障和第四纪更新世气候振荡影响双斑乙蠊谱系地理格局)[J].昆虫学报,2022(02):235-245
A类:
线粒体基因和核基因,双斑乙蠊,Sigmella,biguttata,SAMOVA
B类:
第四纪,纪更新,地理格局,遗传分化,分化程度,该种,种地,地理分布格局,地理种群,ND1,ITS,MEGA,DnaSP,Arlequin,遗传多样性,中性检验,错配,配分,种群历史动态,最大似然法,maximum,likelihood,ML,贝叶斯法,Bayesian,inference,BI,建系,系统发育树,邻接,网络算法,单倍型,网络图,COI,替换率,分化时间,Hd,拓扑结构,支持率,支系,遗传结构分析,基因流,Nm,Fst,动态检测,Group,种群扩张,末次间冰期,中更新世,Ma,潮湿,气候环境,群发,谱系地理学
AB值:
0.293335
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