典型文献
中国4省猕猴桃细菌性溃疡病菌的生物型检测和遗传多样性分析
文献摘要:
由丁香假单胞菌猕猴桃致病变种Pseudomonas syringae pv.actinidiae(Psa)侵染引起的猕猴桃细菌性溃疡病(kiwifruit bacterial canker)是全球猕猴桃生产上最具毁灭性的细菌病害.为探明福建、安徽、四川和陕西4省Psa菌株的生物型和遗传多样性,用5对PCR特异性引物PsaJ-F/-R、PsaK-F/-R、Tac-F/-R、Con002-F/-R和avrRps4-F1/-R2 检测 Psa 菌株的生物型;用 4 对 PCR 引 物 27F/1492R、PsaF1/R2、gapA-Fps/Rps 和 rpoD+364s/-1222ps 分别扩增16S rRNA、ITS、gapA和rpoD基因,进行多基因联合分析Psa菌株的遗传多样性.结果表明,特异性引物Tac-F/-R从47株Psa菌株中均能扩增出一条545 bp的特异条带,其他4对引物未扩增出任何条带,说明供试Psa菌株的生物型均为biovar 3.多基因联合分析表明,4省Psa存在丰富的遗传多样性,4个群体共检测出27个单倍型,单倍型多样性为0.955.安徽、福建、四川和陕西群体的单倍型数差异较大,分别为1、8、12个和12个.4个群体的多态性位点数、核苷酸多样性和平均核苷酸差异数差异极显著(P<0.01),其中福建群体的多态性最丰富,而安徽群体的多态性最低.AMOVA分析表明,3.6%的遗传变异来源于种群间,而96.4%的遗传变异来源于种群内,说明种群内变异是遗传变异的主要来源.遗传分化分析表明,安徽省Psa群体与其他3个群体间的遗传分化极高(Fst>0.175),福建、四川和陕西群体间的遗传分化水平较低(Fst<0.017).研究结果有利于了解福建省Psa的来源,为阻断Psa的传播和猕猴桃细菌性溃疡病的长期可持续控制提供了理论参考.
文献关键词:
猕猴桃细菌性溃疡病菌;生物型;遗传多样性;多基因联合分析;猕猴桃
中图分类号:
作者姓名:
代玉立;兰成忠;甘林;刘晓菲;龚国淑;杨秀娟
作者机构:
福建省农业科学院植物保护研究所,福建省作物有害生物监测与治理重点实验室,福建省作物有害生物绿色防控工程研究中心,福州 350013;四川农业大学农学院,成都 611130
文献出处:
引用格式:
[1]代玉立;兰成忠;甘林;刘晓菲;龚国淑;杨秀娟-.中国4省猕猴桃细菌性溃疡病菌的生物型检测和遗传多样性分析)[J].植物保护,2022(06):58-68
A类:
猕猴桃细菌性溃疡病菌,PsaJ,Con002,avrRps4,1492R,PsaF1,gapA,Rps,rpoD+364s,1222ps,biovar
B类:
生物型,遗传多样性分析,丁香假单胞菌猕猴桃致病变种,Pseudomonas,syringae,pv,actinidiae,侵染,kiwifruit,bacterial,canker,毁灭性,细菌病害,明福,特异性引物,PsaK,Tac,27F,Fps,16S,rRNA,ITS,多基因联合分析,bp,条带,出任,单倍型多样性,多态性位点,核苷酸多样性,异数,建群,AMOVA,遗传变异,遗传分化,群体间,化极,Fst,持续控制
AB值:
0.210199
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