[目的]本文旨在开发纤毛鹅观草特异的寡核苷酸(oligonucleotide,oligo)探针,进一步完善纤毛鹅观草染色体鉴定技术.[方法]利用前期选育的普通小麦-纤毛鹅观草异附加系DA2Sc L和DA6Sc,通过流式分拣和基因组二代测序获得纤毛鹅观草染色体6Sc和染色体臂2Sc长臂的基因组序列,利用Repeatexplorer2/TAREAN软件从中鉴定出卫星重复序列并设计成oligo探针,通过荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)分析所开发oligo探针的应用价值.[结果]从6Sc和2Sc L基因组序列中共鉴定出11个卫星重复序列并开发成11个oligo探针,oligo-FISH结果表明,其中6个探针可以在纤毛鹅观草染色体上产生明显杂交信号,而在小麦染色体上未产生明显杂交信号,可用于特异鉴定小麦背景中的纤毛鹅观草染色体或片段.对1套普通小麦-纤毛鹅观草异附加系oligo-FISH分析发现,oligo-2Sc L-163和oligo-6Sc-111仅在Sc基因组染色体上产生明显信号,可作为纤毛鹅观草Sc组特异探针;将oligo-2Sc L-161和oligo-2Sc L-163组合,对1整套二体异附加系进行双色oligo-FISH,构建了纤毛鹅观草染色体的oligo-FISH核型.[结论]本研究提供了纤毛鹅观草重复序列组成的初步信息,开发的探针能特异鉴定纤毛鹅观草染色体,阐明纤毛鹅观草2个基因组的来源和分化,对推动纤毛鹅观草优异基因的转移和利用有重要意义.

纤毛鹅观草;普通小麦-纤毛鹅观草异附加系;染色体分拣;卫星重复序列;寡聚核苷酸探针;荧光原位杂交

程梦豪;Miroslava Karafiátová;孙昊杰;Kate(r)ina Holu?ová;Jaroslav Dole?el;宋新颖;王海燕;王秀娥

南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/细胞遗传研究所/现代作物生产省部共建协同创新中心,江苏 南京210095;捷克科学院实验植物学研究所/哈纳地区生物技术和农业研究中心,捷克共和国 奥洛穆茨77900

南京农业大学学报

[1]程梦豪;Miroslava Karafiátová;孙昊杰;Kate(r)ina Holu?ová;Jaroslav Dole?el;宋新颖;王海燕;王秀娥-.基于纤毛鹅观草特异的卫星重复序列开发寡核苷酸探针)[J].南京农业大学学报,2022(03):442-452

纤毛鹅观草,卫星重复序列,异附加系,DA2Sc,DA6Sc,6Sc,Repeatexplorer2,TAREAN,染色体分拣,寡聚核苷酸探针

寡核苷酸探针,oligonucleotide,鉴定技术,选育,普通小麦,过流,二代测序,长臂,基因组序列,计成,荧光原位杂交,fluorescence,situ,hybridization,FISH,发成,整套,双色,核型,动纤毛,异基因

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