典型文献
高低峰值骨量人群生物标志物差异及其在骨质疏松中的诊疗价值
文献摘要：
目的 通过生物信息学分析高低峰值骨量人群生物标志物的差异,并验证其在骨质疏松症中的诊疗价值.方法 从GEO数据库获取高低峰值骨量人群基因表达数据集(GSE7158),利用R语言进行基因差异表达分析,然后进行差异基因GO功能注释和KEGG通路富集分析.利用STRING数据库获取差异基因蛋白互作网络,利用Cytoscape中的CytoHubba插件及R语言筛选得到关键基因及关键基因互作网络.最后,验证关键基因在骨质疏松症中的表达及诊疗价值.结果 共筛选得到高低峰值骨量人群差异表达基因182个,包括73个下调和109个上调基因.KEGG通路分析中破骨细胞分化通路、PI3K-AKT信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路和铁死亡信号通路值得关注.PPI网络分析得到11个关键基因:MCM7、BUB3、RBBP7、GNG2、FSHR、PCNA、CCR5、CDK16、SRSF7、NPM1和CPSF6;进一步验证分析发现CCR5、CDK16、RBBP7和SRSF7和骨质疏松症密切相关.结论 研究发现CCR5、CDK16、RBBP7和SRSF7可能与骨质疏松症的发病密切相关,可能成为早期筛选骨质疏松症高风险人群的生物标志物,对骨质疏松症的防治发挥重要作用,为后续进一步实验研究及临床治疗提供了有效依据.
文献关键词：
峰值骨量;骨质疏松;生物信息学分析;蛋白互作网络;生物标志物
中图分类号：
作者姓名：
林适;袁嘉尧;林贤灿;杨彬彬;林燕平;黄佳纯;连晓航;万雷;黄宏兴
作者机构：
广州中医药大学第三临床医学院,广东 广州510000;广州中医药大学第三附属医院,广东 广州510240
文献出处：
引用格式：
[1]林适;袁嘉尧;林贤灿;杨彬彬;林燕平;黄佳纯;连晓航;万雷;黄宏兴-.高低峰值骨量人群生物标志物差异及其在骨质疏松中的诊疗价值)[J].中国骨质疏松杂志,2022(05):625-630,642
A类：
GSE7158,BUB3,RBBP7,GNG2,CDK16,SRSF7
B类：
低峰,峰值骨量,群生,生物标志物,诊疗价值,生物信息学分析,骨质疏松症,GEO,基因表达数据,基因差异表达,差异表达分析,差异基因,功能注释,通路富集分析,STRING,蛋白互作网络,Cytoscape,CytoHubba,插件,选得,关键基因,基因互作,差异表达基因,通路分析,破骨细胞分化,PI3K,AKT,糖尿病并发症,RAGE,铁死亡,PPI,MCM7,FSHR,PCNA,CCR5,NPM1,CPSF6,验证分析,高风险人群
AB值：
0.240181
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