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基于发病机制分析2型糖尿病周围神经病变的关键基因及重要通路
文献摘要：
目的 筛选2型糖尿病周围神经病变(type 2 diabetic peripheral neuropathy,T2DPN)关键基因及重要信号通路,从分子生物学角度分析糖尿病周围神经病变(diabetic peripheral neuropathy,DPN)的发病机制,为DPN精准治疗提供新的诊疗方向.方法 从公共基因芯片数据库GEO下载DPN的相关芯片数据(GSE95849),利用R语言筛选DPN和正常健康人之间的差异表达基因,用GO分析、KEGG分析对DEGs进行功能注释,由Cy-toscape软件将DEGs可视化,再构建PPI网络,最终筛选出核心基因.筛选出核心基因后用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证核心基因在18例T2DPN患者外周血淋巴细胞和20名健康人外周血淋巴细胞的表达情况.选取2021年6-12月福建医科大学附属第二医院内分泌科住院患者20例及体检中心健康人群18名作为研究对象.结果 筛选出627个差异表达基因.GO分析表明差异表达基因生物学功能主要涉及炎症反应、细胞凋亡过程、免疫反应,细胞膜、质膜、细胞质的组成成分.KEGG分析表明差异表达基因主要和PI3K-Akt信号通路等过程有关.利用PPI网络在其中挑选出了TLR4核心基因,并经qRT-PCR实验证实TLR4核心基因在周围神经病变后表达升高(P=0.038).结论 通过生物信息学方法预测了DPN的关键基因并挑选出TLR4核心基因,并用qRT-PCR实验验证了TLR4可能与T2DPN的发生发展密切相关,在基因层面为T2DPN的发病机制与精准治疗提供新的思路.
文献关键词：
2型糖尿病;周围神经病变;生物信息学;TLR4
中图分类号：
作者姓名：
陈晓毓;马匠心;张海滨;陈旎瑶;刘清权
作者机构：
福建医科大学附属第二医院内分泌科,福建泉州 362000;福建医科大学附属第二医院心血管内科,福建泉州 362000
文献出处：
引用格式：
[1]陈晓毓;马匠心;张海滨;陈旎瑶;刘清权-.基于发病机制分析2型糖尿病周围神经病变的关键基因及重要通路)[J].糖尿病新世界,2022(24):9-13
A类：
T2DPN,GSE95849
B类：
机制分析,糖尿病周围神经病变,关键基因,type,diabetic,peripheral,neuropathy,分子生物学,精准治疗,基因芯片,GEO,下载,差异表达基因,DEGs,功能注释,Cy,toscape,再构,PPI,核心基因,qRT,人外周血淋巴细胞,内分泌科,住院患者,体检中心,健康人群,名作,生物学功能,免疫反应,细胞膜,质膜,细胞质,组成成分,PI3K,Akt,挑选出,TLR4,生物信息学方法
AB值：
0.191091
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