典型文献
基于SSR标记的野生黑木耳种质资源遗传多样性研究
文献摘要:
野生黑木耳(Auricularia heimuer)种质资源丰富,具有许多优异的特性,是重要的遗传育种材料,利用基于黑木耳全基因组序列设计的30对SSR引物(24对为特异性强的引物,分布于已经构建的黑木耳遗传连锁图谱的8个连锁群上,其余6对为多态性好的引物)对收集自国内黑木耳主要分布地区(云南、吉林、黑龙江等8个省)、国外黑木耳主要分布地区(朝鲜、俄罗斯)的72个野生菌株进行遗传多样性分析.结果表明:30对SSR引物共检测到211个等位基因位点,每对引物扩增出的位点数为5~12个,多态性位点丰富,比率高达100%;30对SSR引物的平均Shannon's信息指数、观测杂合度、期望杂合度和多态性信息含量分别为1.532、0.469、0.722和0.717;供试菌株间遗传相似系数为0.056~0.951,有75.16%菌株间相似系数小于0.5;在相似系数为0.718处,可将菌株分为7个类群,其中JAUAH 214(吉林省)、JAUAH 251(云南省)、JAUAH 282(吉林省)、JAUAH 301(云南省)和JAUAH 386(朝鲜)均独立成群,菌株间差异极大.筛选出条带清晰、多态性信息含量高、能完全区分72个供试菌株,并可用于二维码指纹图谱构建的SSR核心引物9对.研究结果为黑木耳遗传育种及种质资源保护、智能化管理提供参考.
文献关键词:
野生黑木耳;种质资源;SSR标记;遗传多样性;核心引物
中图分类号:
作者姓名:
尹莉岚;姚方杰;石晨阳;鲁丽鑫;王婷;刘威
作者机构:
吉林农业大学园艺学院,吉林长春130118;食药用菌教育部工程研究中心,吉林长春130118
文献出处:
引用格式:
[1]尹莉岚;姚方杰;石晨阳;鲁丽鑫;王婷;刘威-.基于SSR标记的野生黑木耳种质资源遗传多样性研究)[J].食用菌学报,2022(04):1-9
A类:
heimuer,JAUAH
B类:
SSR,野生黑木耳,多样性研究,Auricularia,遗传育种,育种材料,全基因组序列,序列设计,遗传连锁图谱,连锁群,分布地,朝鲜,野生菌株,遗传多样性分析,等位基因,基因位点,多态性位点,Shannon,杂合度,多态性信息含量,遗传相似系数,类群,吉林省,立成,成群,株间差异,条带,二维码,指纹图谱,图谱构建,核心引物,种质资源保护,智能化管理
AB值:
0.227457
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