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基于RNA-Seq技术的淹水胁迫下2个北美鹅掌楸无性系表达差异基因分析
文献摘要：
北美鹅掌楸是优良用材和绿化树种,但不耐水涝的特征阻碍了其广泛推广应用.本研究对北美鹅掌楸耐淹无性系和淹水敏感无性系淹水胁迫4 d后的叶片进行Illumina HiSeqTM PE100高通量转录组测序,对2个无性系淹水前后的差异表达基因(DGEs)进行比较分析.结果表明,与对照相比,耐淹无性系检测到3809个差异基因中,2015个基因上调表达,1793个下调表达;敏感无性系淹水后检测到10389个差异基因,其中4488个基因上调表达,5901个基因下调表达.2个无性系淹水后的DGEs都富集到糖代谢、碳代谢、植物激素信号转导、光合作用、氨基酸代谢等方面,说明淹水胁迫对北美鹅掌楸的基础代谢影响较大.但耐淹无性系通过调节光反应中心的效率,淀粉、蔗糖、果糖等碳水化合物的储备,以及糖酵解等发酵途径来提供其生存所需能量,减轻淹水胁迫造成的不良影响,从而使耐淹北美鹅掌楸无性系表现出较高的淹水耐受性,为下一步北美鹅掌楸耐淹分子机理研究奠定了基础.
文献关键词：
北美鹅掌楸;淹水胁迫;高通量测序;差异表达基因
中图分类号：
作者姓名：
郭雄昌;孙小艳;伍祎翌;刘淑娟;李彦强;刘晖
作者机构：
江西省科学院生物资源研究所,330096,南昌;江西省重金属污染生态修复工程技术研究中心,江西省科学院流域生态研究所,330096,南昌;江西省红壤及种质资源研究所,331717,南昌
文献出处：
引用格式：
[1]郭雄昌;孙小艳;伍祎翌;刘淑娟;李彦强;刘晖-.基于RNA-Seq技术的淹水胁迫下2个北美鹅掌楸无性系表达差异基因分析)[J].江西科学,2022(06):1071-1076,1123
A类：
B类：
淹水胁迫,北美鹅掌楸,无性系,表达差异,差异基因分析,用材,绿化树种,不耐,耐水,水涝,耐淹,水敏,Illumina,HiSeqTM,PE100,高通量转录组测序,差异表达基因,DGEs,糖代谢,碳代谢,植物激素,激素信号,信号转导,光合作用,氨基酸代谢,基础代谢,光反应,蔗糖,果糖,碳水化合物,糖酵解,耐受性,分子机理
AB值：
0.228917
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