典型文献
一种纤维素降解菌群的宏蛋白质组
文献摘要:
应用液相色谱-串联质谱联用(LC-MS/MS)对一个能够降解纤维素的微生物群落FPDM在滤纸培养基中不同降解时间点的宏蛋白质组进行定性和定量分析,共检测到608种蛋白质,其中有40种为已注释纤维素酶,并观察到伴随纤维素降解过程的进行,纤维素酶的相对丰度变化与纤维素酶的功能相关.对宏蛋白质组的物种来源进行分析,表明群落FPDM主要由Sporocytophaga、Cohnella和Her-baspirillum组成,进一步分析发现分别是Sporocytophaga和Cohnella动态主导了纤维素在前中期与中后期的协同降解.通过短时间序列表达水平挖掘机(STEM)聚类分析的方法,预测了 5种未被注释蛋白的功能,包含2种纤维素降解前中期相关蛋白与3种纤维素降解中后期相关蛋白.
文献关键词:
纤维素;降解群落;宏蛋白质组学;液相色谱-串联质谱联用
中图分类号:
作者姓名:
刘韪铭;杨明;李宪臻;杨帆
作者机构:
大连工业大学 生物工程学院,辽宁 大连 116034
文献出处:
引用格式:
[1]刘韪铭;杨明;李宪臻;杨帆-.一种纤维素降解菌群的宏蛋白质组)[J].大连工业大学学报,2022(05):319-325
A类:
纤维素降解菌群,FPDM,Sporocytophaga,Cohnella,baspirillum,降解群落
B类:
串联质谱,LC,微生物群落,滤纸,降解时间,定性和定量分析,种蛋,纤维素酶,降解过程,相对丰度,物种来源,Her,前中期,协同降解,序列表,挖掘机,STEM,宏蛋白质组学
AB值:
0.201495
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