典型文献
暴马丁香的叶绿体基因组特征分析
文献摘要:
为了解暴马丁香的叶绿体基因组的特征,本研究分析该叶绿体基因组结构和基因构成特征,并进行系统演化基因组分析.结果表明:(1)暴马丁香叶绿体基因组的功能基因有132个,其中包括8个rRNA基因,36个tRNA基因和88个蛋白编码基因.(2)在暴马丁香叶绿体基因组的密码子组成中,RSCU值>1的密码子有30个,其中以A/U碱基结尾的有27个;RSCU值<1的密码子有32个,其中以G/C碱基结尾的的密码子偏多,为29个.(3)在暴马丁香的叶绿体基因组中,检测出106个散在重复序列,包括61个正向重复序列和45个回文重复序列;检测到218个SSR位点,为其中211个位点成功设计出PCR引物.(4)通过邻接法(NJ)对暴马丁香及暴马丁香之外的42种木犀科植物的叶绿体基因组构建系统发育树,结果显示:暴马丁香与丁香属植物北京丁香的亲缘关系最近.本研究为系统演化和种质资源的鉴定等研究奠定理论基础,同时为暴马丁香的保护遗传学和资源开发利用等研究提供科学依据.
文献关键词:
暴马丁香;叶绿体基因组;散在重复序列;密码子偏好性;系统发育分析
中图分类号:
作者姓名:
王久利;郑旭;邓因子
作者机构:
青海省特色经济植物高值化利用 重点实验室,青海 西宁 810007;青海民族大学 生态环境与资源学院,青海 西宁 810007
文献出处:
引用格式:
[1]王久利;郑旭;邓因子-.暴马丁香的叶绿体基因组特征分析)[J].阜阳师范大学学报(自然科学版),2022(01):55-64
A类:
B类:
暴马丁香,叶绿体基因组,基因组特征,基因组结构,构成特征,系统演化,基因组分析,香叶,功能基因,rRNA,tRNA,蛋白编码,编码基因,密码子组,RSCU,碱基,结尾,散在重复序列,回文,SSR,个位,引物,邻接,接法,NJ,木犀科,组构,建系,系统发育树,丁香属,亲缘关系,种质资源,保护遗传学,资源开发利用,密码子偏好性,系统发育分析
AB值:
0.258001
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