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典型文献
新疆柳树花变叶植原体分子鉴定
文献摘要:
为研究新疆7个地区柳树花变叶病为何种病原物所造成,本研究以分子生物学技术对其进行鉴定.通过CTAB法提取柳树总DNA,对其16S rRNA基因和tuf基因进行PCR扩增,将测序得到的基因片段通过Blast比对、同源性比较,构建系统进化树和16S rRNA虚拟RFLP分析.结果显示,PCR扩增分别获得16S rRNA(1 238 bp)和tuf(824 bp)的片段,证明该病害与植原体有关,将其命名为柳树花变叶植原体(WPP);16S rRNA 序列分析表明,WPP 与中国桃黄化植原体('Prunus persica'yellows phytoplasma)、枣疯病('Ziziphus jujuba'witches'-broom phytoplasma)、杏褪绿卷叶植原体(Apricot leaf roll phytoplasma)同源性均为99.68%;16S rRNA虚拟RFLP分析结果表明,WPP与枣疯病株系(GenBank登录号:AB052876)有99.8%的相似性,虚拟RFLP模式与16SrV-B亚组的参考模式相同,相似系数为1.00,进一步证明WPP为16SrV-B亚组成员.WPP tuf基因与榆树黄化组(EY)同源性达99%以上,系统进化树显示,柳树花变叶植原体与榆树黄化组(16SrV)植原体聚为一枝.柳树花变叶植原体属于16SrV-B、tuf-B亚组.
文献关键词:
柳树;植原体;分子鉴定;16SrRNA;tuf
作者姓名:
李丰;赖刚刚;赵志慧;张萍;朱天生
作者机构:
塔里木大学植物科学学院,南疆农业有害生物综合治理兵团重点实验室/南疆特色果树高效优质栽培与深加工技术国家地方联合工程实验室,新疆阿拉尔 843300
文献出处:
引用格式:
[1]李丰;赖刚刚;赵志慧;张萍;朱天生-.新疆柳树花变叶植原体分子鉴定)[J].西北农业学报,2022(10):1374-1380
A类:
witches,broom,AB052876,16SrV
B类:
柳树,树花,植原体,分子鉴定,原物,分子生物学技术,CTAB,tuf,Blast,同源性比较,建系,系统进化树,RFLP,bp,WPP,序列分析,黄化,Prunus,persica,yellows,phytoplasma,枣疯病,Ziziphus,jujuba,卷叶,Apricot,leaf,roll,病株,株系,GenBank,登录号,相似系数,组成员,榆树,EY,一枝,16SrRNA
AB值:
0.307645
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