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LAMA3在泛癌中的表达水平及其与泛癌预后、免疫微环境的相关性分析
文献摘要:
目的 分析层粘连蛋白3(Laminin subunit alpha 3,LAMA3)在泛癌中的表达水平及其与泛癌患者预后、免疫微环境之间的关系.方法 本研究从多个数据库中收集转录组、预后、免疫相关数据,可视化分析LAMA3在泛癌中的表达水平及其与泛癌预后、免疫微环境的相关性.结果 与正常组织相比,LAMA3在11种肿瘤中显著高表达,如结肠癌(colon adenocarcinoma,COAD),肾透明细胞癌(kidney renal clear cell carcinoma,KIRC),胰腺癌(pancreatic adenocarcinoma,PAAD)等;在11种肿瘤中显著低表达,如胶质母细胞瘤(glioblastoma multiforme,GBM)、脑低级别胶质瘤(brain lower grade glioma,LGG)、皮肤黑色素瘤(skin cutaneous melanoma,SKCM)等.LAMA3表达水平不仅与包括PAAD在内的多种肿瘤预后显著相关,还与SKCM等多种肿瘤的肿瘤突变负荷(tumor mutation burden,TMB)、微卫星不稳定性(microsatellite instability,MSI)和肿瘤免疫浸润显著相关.此外,基因共表达分析结果表明LAMA3与多种常见的免疫基因表达显著相关.结论 LAMA3可作为泛癌预后、免疫治疗反应评估的生物标志物.
文献关键词:
层粘连蛋白3;泛癌;预后;免疫微环境
中图分类号:
作者姓名:
张梦杰;刘俊丽;杨娜;杨玲;韩继明
作者机构:
延安大学医学院,陕西 延安 716000;空军军医大学生物化学与分子生物学教研室,陕西 西安 710032
文献出处:
引用格式:
[1]张梦杰;刘俊丽;杨娜;杨玲;韩继明-.LAMA3在泛癌中的表达水平及其与泛癌预后、免疫微环境的相关性分析)[J].延安大学学报(医学科学版),2022(04):6-11
A类:
B类:
LAMA3,泛癌,免疫微环境,层粘连蛋白,Laminin,subunit,alpha,转录组,免疫相关,正常组织,结肠癌,colon,adenocarcinoma,COAD,肾透明细胞癌,kidney,renal,clear,cell,KIRC,胰腺癌,pancreatic,PAAD,低表达,胶质母细胞瘤,glioblastoma,multiforme,GBM,低级别胶质瘤,brain,lower,grade,glioma,LGG,皮肤黑色素瘤,skin,cutaneous,melanoma,SKCM,肿瘤预后,肿瘤突变负荷,tumor,mutation,burden,TMB,微卫星不稳定性,microsatellite,instability,MSI,肿瘤免疫浸润,共表达,表达分析,免疫基因表达,免疫治疗,治疗反应,生物标志物
AB值:
0.43577
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