典型文献
赤红球菌甲苯胁迫响应蛋白基因的克隆、生物信息学分析和表达变化研究
文献摘要：
从赤红球菌SD3中克隆了一个甲苯胁迫响应蛋白基因tsrp1,该基因长度为417 bp,在GenBank的登录号为MK371001.该基因编码的蛋白质Tsrp1由138个氨基酸残基组成,理论分子量为14.2 kDa,理论等电点为4.82,不稳定系数为18.68,总平均疏水指数为-0.154,属于酸性稳定的亲水蛋白.Tsrp1无信号肽和二硫键、无跨膜区、无保守结构域,存在于细胞质中.在R.ruber SD3中Tsrp1蛋白与R.rhodochrous、R.zopfii、R.pyridinivorans、R.hoagii、M.brevis和C.manganitolerans中的序列相似蛋白的相似性分别为94.93％、71.29％、67.96％、44.58％、42.05％ 和35.00％.通过分子对接发现Tsrp1与c-di-GMP存在相互作用.在甲苯和苯酚胁迫下,在赤红球菌SD3中tsrp1基因的表达分别为原来的40.19倍和14.73倍.
文献关键词：
赤红球菌;有机溶剂胁迫;荧光定量PCR;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
张帆;袁媛;曾艳;付薇;彭仁
作者机构：
江西师范大学生命科学学院,江西 南昌 330022
文献出处：
引用格式：
[1]张帆;袁媛;曾艳;付薇;彭仁-.赤红球菌甲苯胁迫响应蛋白基因的克隆、生物信息学分析和表达变化研究)[J].江西师范大学学报（自然科学版）,2022(02):140-146
A类：
赤红球菌,tsrp1,MK371001,Tsrp1,rhodochrous,zopfii,pyridinivorans,hoagii,manganitolerans,有机溶剂胁迫
B类：
甲苯,胁迫响应,生物信息学分析,表达变化,变化研究,SD3,bp,GenBank,登录号,基因编码,氨基酸残基,基组,分子量,kDa,等电点,不稳定系数,疏水,亲水,信号肽,二硫键,保守结构域,细胞质,ruber,brevis,分子对接,接发,GMP,苯酚
AB值：
0.237858
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