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基于单细胞转录组测序数据分析胃癌调节性T细胞特征
文献摘要：
目的 探究胃癌及胃正常组织的细胞组成,分析调节性T细胞在胃癌及胃正常组织中的差异.方法 下载胃癌单细胞转录组测序数据并进行质控、降维聚类及细胞注释,提取调节性T细胞进行差异基因、轨迹、GSVA及细胞相互作用分析,明确正常组织和肿瘤组织来源的调节性T细胞特征.结果 在细胞组成方面,不同患者、不同样本类型之间存在较大异质性.与正常组织相比,调节性T细胞在肿瘤组织占比更高,与细胞死亡、细胞周期等通路相关.细胞相互作用分析显示,肿瘤组织中调节性T细胞与其他细胞相互作用频率更低、强度更大,互作模式具有显著变化.结论 调节性T细胞主要在胃癌肿瘤微环境中存在.胃癌及胃正常组织中调节性T细胞在数量、功能等方面存在显著差异.
文献关键词：
胃癌;单细胞RNA测序;细胞组成;调节性T细胞;细胞互作
中图分类号：
作者姓名：
高惠茹;杜甜甜;王允山;杜鲁涛;王传新
作者机构：
山东大学第二医院检验医学中心,山东 济南250033;山东省肿瘤标志物检测工程实验室,山东 济南250033
文献出处：
引用格式：
[1]高惠茹;杜甜甜;王允山;杜鲁涛;王传新-.基于单细胞转录组测序数据分析胃癌调节性T细胞特征)[J].山东大学学报（医学版）,2022(05):43-49
A类：
瘤组织占比
B类：
单细胞转录组测序,序数,胃癌,调节性,正常组织,细胞组成,下载,质控,降维聚类,差异基因,GSVA,相互作用分析,肿瘤组织,本类,大异,细胞死亡,细胞周期,作用频率,癌肿,肿瘤微环境,细胞互作
AB值：
0.280939
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