典型文献
阪崎肠杆菌在超高压条件下的转录组差异分析
文献摘要:
文章以阪崎肠杆菌为研究对象,以50、100、200、300、400 MPa为杀菌条件对其进行超高压处理,阪崎肠杆菌每毫升活菌数由109.39 CFU分别减少至109.25、109.12、109.05、108.68、106.27 CFU.以50 M Pa超高压条件对阪崎肠杆菌进行转录组分析,研究其在50 M Pa超高压处理下基因的表达情况.结果表明:该条件处理引起635个基因差异表达,其中481个基因表达上调,154个基因表达下调.基因本体(gene ontology,GO)功能分析显示,高压处理引起分子功能组离子型谷氨酸受体、兴奋性胞外配体、谷氨酸受体活性和神经递质受体活性的显著富集;京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析发现,差异表达基因主要涉及腺苷三磷酸结合盒ABC转运蛋白(ATP-binding cassette transporter),双组分调控系统、硫代谢和氮代谢等途径.结果表明,超高压导致细胞膜上的转运蛋白受到损伤,继而影响细胞对金属离子、脂质、氮代谢物质等的跨膜转运能力,导致细胞新陈代谢紊乱.该研究为阪崎肠杆菌的耐压机制提供了理论依据.
文献关键词:
阪崎肠杆菌;超高压;转录组学;生物信息学
中图分类号:
作者姓名:
廖巧明;陶晗
作者机构:
合肥工业大学 食品与生物工程学院 ,安徽 合肥 230601
文献出处:
引用格式:
[1]廖巧明;陶晗-.阪崎肠杆菌在超高压条件下的转录组差异分析)[J].合肥工业大学学报(自然科学版),2022(10):1400-1406
A类:
B类:
阪崎肠杆菌,压条,转录组差异分析,杀菌条件,超高压处理,每毫升,活菌数,CFU,转录组分析,该条,基因差异表达,基因本体,gene,ontology,功能分析,功能组,离子型,谷氨酸受体,兴奋性,神经递质,京都基因与基因组百科全书,Kyoto,Encyclopedia,Genes,Genomes,通路分析,差异表达基因,腺苷三磷酸,ABC,转运蛋白,ATP,binding,cassette,transporter,双组分调控系统,硫代谢,氮代谢,细胞膜,金属离子,代谢物质,跨膜转运,转运能力,新陈代谢,代谢紊乱,耐压,压机,转录组学
AB值:
0.370735
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