典型文献
鼠伤寒沙门氏菌LT2 Hfq与fadL、ompN、ybfM mRNA 5'UTR结合位点的预测与验证分析
文献摘要：
通过5'RACE技术分析fadL、ompN、ybfM mRNA的5'UTR,并筛查fadL、ompN、ybfM mRNA 5'UTR中Hfq结合偏好型基序(ARN)n.利用λ-Red同源重组酶和FLP重组酶系统构建fadL、ompN、ybfM基因(ARN)n基序缺失基础上的lacZ基因融合菌株,运用P22噬菌体转导技术构建相应的hfq基因缺失菌株,通过β-半乳糖苷酶试验检测重组菌株的蛋白水平.结果显示,fadL中筛选出ARN-1(AAAAAA)、ARN-2(AAAAATAAT),其缺失降低了fadL的蛋白表达量,分别降低72％、56％;ompN中筛选出ARN-1(GTTTTT)、ARN-2(TCTTTT)、ARN-4(TTTGCT),其缺失提高了ompN的蛋白表达量,分别提高了1.29、1.30、1.07倍,ARN-3(ATTATT)缺失使ompN的蛋白表达量降低了10％;ybfM中筛选出ARN-1(AAGAGG)、ARN-2(AGCAAT)、ARN-3(AGTAAA)、ARN-4(AAAAATAGT)、ARN-5(AACAGAAAG),其缺失均增加了ybfM蛋白水平变化,分别为4.20、3.99、10.90、227.00、46.00倍.结果表明,ybfM、ompN、fadL中(ARN)n位点不同缺失能导致ybfM、ompN、fadL表达水平出现上调或下调,部分(ARN)n序列缺失可影响Hfq对相应靶基因蛋白水平调控作用.
文献关键词：
沙门氏菌;λ-red同源重组系统;伴侣蛋白Hfq;外膜蛋白
中图分类号：
作者姓名：
令狐远凤;杨阳;潘永;段世宇;张家莉;张宝太;杨琦
作者机构：
贵州大学动物科学学院,贵州 贵阳550025;贵州大学动物疫病研究所,贵州 贵阳550025;贵州省农业科学院畜牧兽医研究所,贵州 贵阳550025
文献出处：
引用格式：
[1]令狐远凤;杨阳;潘永;段世宇;张家莉;张宝太;杨琦-.鼠伤寒沙门氏菌LT2 Hfq与fadL、ompN、ybfM mRNA 5'UTR结合位点的预测与验证分析)[J].福建农林大学学报（自然科学版）,2022(05):636-643
A类：
fadL,ompN,ybfM,AAAAAA,AAAAATAAT,GTTTTT,TCTTTT,TTTGCT,ATTATT,AAGAGG,AGCAAT,AGTAAA,AAAAATAGT,AACAGAAAG
B类：
鼠伤寒沙门氏菌,LT2,Hfq,UTR,结合位点,预测与验证,验证分析,RACE,基序,ARN,Red,同源重组,重组酶,FLP,酶系统,系统构建,lacZ,基因融合,P22,噬菌体,转导,技术构建,hfq,基因缺失菌株,半乳糖,糖苷酶,试验检测,重组菌株,水平变化,失能,列缺,靶基因,平调,red,伴侣蛋白,外膜蛋白
AB值：
0.222796
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