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L-色氨酸与α/β-环糊精结合机理的计算研究
文献摘要:
本研究通过分子动力学模拟详细探讨α/β-环糊精(α/β-CD)与L-色氨酸(L-Trp)在水溶液环境下的相互作用.通过利用MM/PBSA方法计算结合自由能,表明α/β-CD在水溶液中能够自发的与L-Trp络合,并且β-CD与L-Trp结合能力更强.通过观察α/β-CD与L-Trp的动态结合过程,并计算氢键数量,CD空腔内水分子数量,以及CD-L-Trp复合物的均方根偏差(RMSD),表明L-Trp加载到CD空腔后驱逐了空腔内的水分子,β-CD与L-Trp结合更加稳定,并且α-CD显示出与之不同的加载方式.
文献关键词:
分子动力学;MM/PBSA;α-CD;β-CD
中图分类号:
作者姓名:
周政忠;刘宜;王乾;郑涛;呼和涛力
作者机构:
常州大学城乡矿山研究院,江苏 常州 213000;中国科学院广州能源研究所,广东 广州 510000
文献出处:
引用格式:
[1]周政忠;刘宜;王乾;郑涛;呼和涛力-.L-色氨酸与α/β-环糊精结合机理的计算研究)[J].化学研究与应用,2022(04):778-786
A类:
B类:
色氨酸,环糊精,结合机理,分子动力学模拟,CD,Trp,水溶液,溶液环境,MM,PBSA,结合自由能,络合,结合能,通过观察,氢键,空腔,水分子,复合物,均方根偏差,RMSD,载到,驱逐,加载方式
AB值:
0.382824
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