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典型文献
基于拮抗及ITS序列分析的河南香菇主产区种质资源鉴定及遗传多样性分析
文献摘要:
应用核糖体基因转录间隔区域(Internal Transcribed Spacer,ITS)序列及拮抗法对河南食用菌主产区香菇栽培菌株进行鉴定,并分析遗传多样性.以收集的41个香菇栽培菌株为样本,两两之间进行拮抗测试分析,提取DNA并进行PCR扩增、回收、测序,采用比对邻接法(neighbor-joinging,NJ)构建系统进化树.结果表明,16个差异菌株拮抗现象明显,其余菌株无拮抗或者拮抗不显著,41个香菇菌株初步分为16个不同菌株及7个不同亚种;ITS序列比对及系统发育分析将41个香菇品种聚为独立进化的4个大类,即3个不同的菌株和8个不同的亚种,种内遗传距离为0.0000~0.0065,与Pleurotus ostreatus(KY962509)种间遗传距离为0.3740.综上所述,"ITS+拮抗法"结合可以明确区分菌株间拮抗、无拮抗及拮抗不明显现象基因序列的相似度、遗传距离的差异及亲缘关系的远近,为香菇品种的鉴定提供理论支撑.
文献关键词:
香菇;ITS;拮抗鉴定;遗传多样性分析
作者姓名:
崔筱;刘芹;孔维丽;张玉亭;胡素娟;王彦坡;康源春;孔维威;袁瑞奇
作者机构:
河南省农业科学院植物营养与资源环境研究所 郑州 450002;西峡县食用菌生产办公室 河南西峡 474599
文献出处:
引用格式:
[1]崔筱;刘芹;孔维丽;张玉亭;胡素娟;王彦坡;康源春;孔维威;袁瑞奇-.基于拮抗及ITS序列分析的河南香菇主产区种质资源鉴定及遗传多样性分析)[J].中国瓜菜,2022(07):31-38
A类:
joinging,KY962509,ITS+,拮抗鉴定
B类:
序列分析,主产区,种质资源鉴定,遗传多样性分析,核糖体基因,基因转录,Internal,Transcribed,Spacer,抗法,食用菌,香菇栽培,测试分析,邻接,接法,neighbor,NJ,建系,系统进化树,亚种,序列比对,系统发育分析,种内,遗传距离,Pleurotus,ostreatus,种间,综上所述,基因序列,亲缘关系,远近
AB值:
0.321153
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