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典型文献
不同竹龄毛竹茎干内生细菌多样性与功能预测
文献摘要:
[目的]研究不同竹龄的毛竹茎干内生细菌群落结构与生物学功能.[方法]对采集于同一竹林的1~5a生毛竹茎干内生细菌进行高通量测序及生物信息分析.[结果]所有样本共检测到细菌21个门和337个属,α多样性指数显示,1 a生毛竹内生细菌多样性最低,Simpson和Shannon指数仅为0.42和1.75;2~5 a生毛竹茎干内生菌种群Simpson指数都超过0.93,种类多样性高,其中,4 a生茎干内生细菌Shannon指数最高,为7.01,显著高于其他竹龄.1 a生毛竹茎干中优势属为欧文氏菌属(Erwinia),2 a生毛竹茎干中优势属苍白杆菌属(Ochrobactrum)、链球菌属(Streptococcus)及根瘤菌科多个属(Genus of Rhizobiaceae),3 a生毛竹内生细菌优势菌属为苍白杆菌属和根瘤菌科的多个属,4 a生毛竹内生细菌优势菌属为苍白杆菌属和梭菌属(Clostridium),5 a生毛竹茎干内生细菌优势菌属为欧文氏菌属、梭菌属和泛菌属(Pantoea),表明不同年龄毛竹其茎干部位内生细菌组成有明显差异.功能预测结果显示,各样本功能主要在碳水化合物降解方面,并且在外源生物降解与代谢、其他氨基酸的代谢和脂质代谢方面1a生与5a生样本有明显下降趋势.[结论]研究结果解析了不同竹龄毛竹内生细菌的种群多样性和变化规律,对于解析毛竹与内生菌的相互作用具有参考价值.
文献关键词:
毛竹;竹龄;内生细菌;多样性
作者姓名:
朱伟垚;林梦婷;吴仲义;许晓晨;赵文宝;宋漳;张清华
作者机构:
福建农林大学林学院森林保护研究所,福州 350002;建阳区华家山毛竹采育场,福建 南平 354203
引用格式:
[1]朱伟垚;林梦婷;吴仲义;许晓晨;赵文宝;宋漳;张清华-.不同竹龄毛竹茎干内生细菌多样性与功能预测)[J].四川农业大学学报,2022(05):766-774
A类:
B类:
竹龄,毛竹,竹茎,茎干,细菌多样性,功能预测,内生细菌群落结构,生物学功能,竹林,5a,生物信息分析,有样,多样性指数,竹内,Simpson,Shannon,内生菌,菌种,种类多样性,生茎,优势属,欧文氏菌,Erwinia,苍白杆菌属,Ochrobactrum,链球菌属,Streptococcus,根瘤菌,Genus,Rhizobiaceae,优势菌,梭菌,Clostridium,泛菌属,Pantoea,细菌组成,碳水化合物,生物降解,脂质代谢,代谢方,1a,本有,种群多样性
AB值:
0.280971
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