典型文献
人源OR51E2基因家族全基因组进化和功能分析
文献摘要：
短链脂肪酸(SCFAs)是膳食纤维在肠道细菌发酵过程中的代谢产物,主要包括乙酸、丙酸和丁酸,可通过结合SCFAs受体影响宿主健康.OR51E2为一种新发现的SCFAs受体,关于OR51E2的系统发育及其功能研究相对缺乏.利用生物信息学方法分析人源OR51E2基因家族基因的氨基酸组成、保守基序、蛋白结构、理化特性和系统进化关系,利用geneMANIA软件分析OR51E2相互作用蛋白的关系,GEPIA2分析OR51E2在直肠腺癌患者的表达和预后分析.结果表明,人源OR51E2基因家族包含OR51E1、OR51E2两种基因,OR51E1、OR51E2在氨基酸组成、开放阅读框保守基序、蛋白结构整体上基本保守,亮氨酸和色氨酸含量分别为最高和最低的氨基酸,包含三个保守基序,皆为单链氨基酸,但也存在部分差异.系统进化树表明,OR51E2基因家族分为三类,即OR51E1、OR51E2、OR51E2,进化关系呈水生动物到陆生动物功能结构复杂化.OR51E2在直肠腺癌患者显著性低表达,预后分析显示OR51E2高表达与低表达直肠腺癌患者风险比值为1.5,logrank P=0.38.对OR51E2基因家族全基因组进化和功能分析,为进一步研究OR51E2肠道代谢和疾病调控机制奠定了基础.
文献关键词：
OR51E2;SCFAs受体;理化特性;相互作用;表达和预后分析;直肠腺癌
中图分类号：
作者姓名：
蒙爱;魏思昂;丁志文;冯焱
作者机构：
山西农业大学生命科学学院,太谷030801;复旦大学中山医院心血管病研究所,上海200032
文献出处：
引用格式：
[1]蒙爱;魏思昂;丁志文;冯焱-.人源OR51E2基因家族全基因组进化和功能分析)[J].科学技术与工程,2022(02):504-510
A类：
OR51E2,geneMANIA,OR51E1
B类：
基因家族,全基因组,基因组进化,功能分析,短链脂肪酸,SCFAs,膳食纤维,肠道细菌,细菌发酵,发酵过程,代谢产物,丙酸,丁酸,宿主健康,新发现,系统发育,功能研究,利用生物,生物信息学方法,家族基因,氨基酸组成,保守基序,蛋白结构,理化特性,进化关系,相互作用蛋白,GEPIA2,直肠腺癌,表达和预后分析,开放阅读框,亮氨酸,色氨酸,酸含量,单链,系统进化树,水生动物,陆生动物,功能结构,低表达,患者风险,风险比,logrank,肠道代谢,调控机制
AB值：
0.278507
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