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典型文献
FFPE组织HPV检测中PCR-反向点杂交技术的应用:两种核酸提取方法的比较
文献摘要:
目的 比较两种不同核酸提取方法在人乳头瘤病毒(HPV)亚型检测中的应用,为实验室选择相应的核酸提取方法来获得有效的HPV结果提供依据.方法 收集25例浸润性宫颈癌福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织标本,采用粗提法和纯化法两种核酸提取方法提取DNA标本,并通过检测DNA浓度、纯度及内参β-Globin来评估DNA质量.将提取的DNA经PCR扩增后,应用PCR-反向点杂交法检测HPV亚型,分析两种提取方法HPV检测结果的有效性及一致性.结果 两种提取方法均能获得适量的DNA用于HPV检测,粗提法较纯化法可获得较高的DNA浓度(P<0.05),但存有一定有机物及蛋白质污染.纯化法较粗提法获得的DNA纯度更高(P<0.05).将粗提法和纯化法提取的DNA用于检测HPV感染,总HPV阳性率分别为92%和96%.采用粗提法提取的DNA标本高危型HPV(HR-HPV)阳性率低于纯化法(92%vs.96%),但单一型HPV16阳性率高于纯化法(44%vs.36%);与纯化法相比,粗提法提取的DNA无法检测出更多型别的混合感染,而FFPE组织标本经纯化法分离后可检测出HPV33、HPV53、HPV58等多型别感染.结论 采用粗提法和纯化法进行FFPE组织核酸提取,均可获得足量DNA用于HPV亚型检测,且HR-HPV阳性率达90%以上.粗提法具有操作简便、耗时较短、成本较低等优势,能够获得有效的HPV结果,但对于HPV多型别感染的检测表现欠佳.
文献关键词:
福尔马林固定石蜡包埋组织;人乳头瘤病毒;宫颈癌;PCR-反向点杂交法
作者姓名:
王诚;童玲玲;刘千琪;况薇
作者机构:
四川大学华西第二医院病理科/出生缺陷与相关妇儿疾病教育部重点实验室,四川成都 610011
文献出处:
引用格式:
[1]王诚;童玲玲;刘千琪;况薇-.FFPE组织HPV检测中PCR-反向点杂交技术的应用:两种核酸提取方法的比较)[J].检验医学与临床,2022(16):2203-2206,2210
A类:
Globin,福尔马林固定石蜡包埋组织
B类:
FFPE,杂交技术,核酸提取,人乳头瘤病毒,得有,浸润性宫颈癌,组织标本,提法,内参,交法,存有,蛋白质污染,高危型,单一型,HPV16,多型,型别,混合感染,HPV33,HPV53,HPV58,足量
AB值:
0.184023
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