典型文献
酒精性股骨头坏死竞争性内源RNA网络及潜在生物标志物的综合分析
文献摘要:
背景:酒精性股骨头坏死与饮酒具有高度的相关性,然而其具体发病机制尚不明确且存在一定的个体差异.目的:构建酒精性股骨头坏死的基因网络图谱,进一步探索酒精性股骨头坏死的潜在发病机制.方法:从广西中医药大学第一附属医院骨二科招募3例酒精性股骨头坏死患者和3名健康志愿者,通过对其外周血进行基因测序筛选具有差异表达的mRNA和lncRNA,通过预测lncRNA-miRNA和miRNA-mRNA的相互作用靶点,使用cytoscape软件构建竞争性内源RNA调控网络.结果 与结论:①通过差异表达分析从酒精性股骨头坏死样本中鉴定出了差异lncRNA 127个、差异mRNA 921个,通过靶基因预测共预测出了205个miRNA及5184个mRNA靶点,最终构建了包含3个lncRNA(SNHG3、MUC19、LINC00476)、5个miRNA(hsa-miR-146b-5p、hsa-miR-139-5p、hsa-miR-126-3p、hsa-miR-193a-3p、hsa-miR-135a-5p)和11个mRNA(PEX5、ACTR3B、CHMP4B、CSMD1、MTRF1、ZNF3、HTR7、NR5A2、SYT14、CASK、ING5)的ceRNA网络,涉及干细胞分化、炎症反应、神经内分泌、基因多态性等多种生物学过程.②结果表明,通过构建竞争性内源网络筛选出了一系列酒精性股骨头坏死潜在的生物标志物,为进一步研究其分子机制及治疗靶点提供了新思路.
文献关键词:
酒精性股骨头坏死;竞争性内源RNA(ceRNA)网络;lncRNA;mRNA;miRNA;生物标志物
中图分类号:
作者姓名:
钱晓芬;曾平;刘金富;陈财;范思奇;农焦;邓伟
作者机构:
广西中医药大学研究生院,广西壮族自治区南宁市 530299;广西中医药大学第一附属医院,广西壮族自治区南宁市 530023
文献出处:
引用格式:
[1]钱晓芬;曾平;刘金富;陈财;范思奇;农焦;邓伟-.酒精性股骨头坏死竞争性内源RNA网络及潜在生物标志物的综合分析)[J].中国组织工程研究,2022(23):3670-3675
A类:
MUC19,LINC00476,PEX5,ACTR3B,CHMP4B,MTRF1,ZNF3,HTR7,SYT14,ING5
B类:
酒精性股骨头坏死,竞争性,潜在生物标志物,饮酒,酒具,个体差异,网络图谱,中医药大学,二科,招募,健康志愿者,其外,基因测序,lncRNA,miRNA,作用靶点,cytoscape,软件构建,调控网络,差异表达分析,靶基因预测,预测出,SNHG3,hsa,146b,5p,3p,193a,135a,CSMD1,NR5A2,CASK,ceRNA,细胞分化,神经内分泌,基因多态性,生物学过程,治疗靶点
AB值:
0.229708
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