苹果茎痘病毒是苹果安全生产的巨大威胁,严重影响苹果产量和质量.探讨苹果茎痘病毒(Apple stem pitting virus,ASPV)在山西省的分布、变异和多样性,可为制定可持续的病毒管理策略提供理论依据.从山西省11个地区采集苹果叶片样品进行RT-PCR检测.结合在线数据库,利用相关软件对文中研究获得的序列进行系统发育、遗传多样性、重组以及种群遗传分化等分析.RT-PCR检测结果显示从山西省11个地区采集的409份苹果叶片样品中,ASPV的检出率为36.33％(临漪)至55.37％(平遥).选择15个ASPV检测为阳性的样品,分别克隆其CP基因并与22个不同的ASPV分离物进行核苷酸和氨基酸一致性分析,发现37个ASPV分离物的核酸一致率为70.27～96.31％,氨基酸一致率为37.04～96.64％,其中,Shanxi-2与JX673826.1的核酸一致率最高,为90.86％,Shanxi-2与MN617853.1的核酸一致率最低,为70.40％.基于CP的进化树分析结果显示37个ASPV分离物被划分为2个进化群体.遗传多样性分析结果表明ASPV种群发生了收缩,且在两个群体之间呈现较大的遗传差异.ASPV-CP基因受负选择压力影响.该研究结果将为评估山西省ASPV的流行病学特征提供重要线索.

苹果茎痘病毒;遗传多样性;外壳蛋白

丁磊;崔正秀;陈伟;吴云锋

西北农林科技大学植物保护学院,旱区作物逆境生物学国家重点实验室,农业部西北黄土高原作物有害生物综合治理重点实验室,杨凌712100;山西师范大学生命科学学院,临汾041000

干旱区资源与环境

[1]丁磊;崔正秀;陈伟;吴云锋-.山西苹果茎痘病毒遗传多样性分析)[J].干旱区资源与环境,2022(02):141-146

苹果茎痘病毒,JX673826,MN617853

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