典型文献
基于转录组测序的柴达木地区枸杞根腐病发病机理研究
文献摘要：
为初步了解柴达木地区枸杞根腐病发病机理,文中通过转录组测序技术对健康和发病枸杞进行测序分析.结果共筛选得到6503个差异表达基因,其中3558个差异上调基因,2945个差异下调基因.通过差异基因GO功能注释分析,GJ(健康组)vs GF(发病组)中差异表达基因主要表现在代谢过程、细胞过程、催化活性、结合、细胞和细胞部分等生物学功能上.KEGG代谢通路分析显示,差异上调基因主要富集在内质网中的蛋白质加工、植物激素信号传导、植物-病原体互作等代谢通路;差异下调基因主要富集在碳代谢、氨基酸生物合成、光合作用生物的碳固定、糖酵解/糖异生、光合作用等通路上.转录因子预测结果显示:24个转录因子表达发生了变化,分别归属于13个转录因子家族,C2H2、TCP、WRKY等多个转录因子的表达均受到不同程度的抑制.利用实时荧光定量PCR技术对挑选的10个关键差异表达基因进行验证,结果显示10个差异表达基因表达趋势与转录组测序相一致.
文献关键词：
枸杞;根腐病;转录组;发病机理
中图分类号：
作者姓名：
方泰军;侯璐;白露超
作者机构：
青海大学农牧学院,西宁810016;青海大学农林科学院,西宁810016
文献出处：
引用格式：
[1]方泰军;侯璐;白露超-.基于转录组测序的柴达木地区枸杞根腐病发病机理研究)[J].干旱区资源与环境,2022(11):133-140
A类：
B类：
柴达木,枸杞根腐病,发病机理,转录组测序技术,测序分析,选得,差异表达基因,差异基因,功能注释,GJ,GF,代谢过程,催化活性,生物学功能,代谢通路分析,内质网,蛋白质加工,植物激素,激素信号传导,病原体,碳代谢,生物合成,光合作用,碳固定,糖酵解,糖异生,归属于,C2H2,TCP,WRKY,相一致
AB值：
0.288036
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
