典型文献
利用生物信息技术及基础实验检验食管鳞癌中白细胞介素-17及相关细胞因子表达情况
文献摘要：
目的 利用生物信息技术探索白细胞介素-17(IL-17)在食管鳞癌中的作用.方法 采用文献计量学方法收集食管鳞癌关于IL-17的相关基础研究,获取相关研究中与之相关的细胞因子;利用人类肿瘤相关基因表达综合数据库(GEO)中的食管鳞癌芯片表达数据对筛选出的关键基因表达情况进行研究.取不同分期食管鳞癌肿瘤与组织标本检测IL-17及相关细胞因子表达情况.结果 搜索数据库,符合纳入标准文献有14篇,其中与IL-17相关的细胞因子有白细胞介素-6(IL-6)、S100钙结合蛋白A8(S100A8)、S100钙结合蛋白A9(S100A9)、基质金属蛋白酶9(MMP-9)、基质金属蛋白酶13(MMP-13),利用RStudio分析GEO数据库中的GSE26886数据集,结果显示IL-17在肿瘤组织中表达量较正常组织高,且其中能够影响IL-17分泌的细胞因子IL-6的表达量也高于正常组织;在IL-17影响的下游因子中S100A8、MMP-9、MMP-13也表现类似结果,但是肿瘤组织中S100A9表达量低于正常组织.免疫组化检测食管鳞癌组织标本结果显示肿瘤组织中IL-17表达量较正常组织表达增加,选取热度较高的MMP-9、IL-6、S100A9行蛋白质免疫印迹,得出结果和GE O提取结果类似.结论 利用GE O数据库检测结果与实践结果类似,可以使用信息技术提取相关结果,进而与临床结合,可以使临床更高效达到研究目的.
文献关键词：
R语言;基因表达综合数据库;食管鳞癌;白细胞介素-17
中图分类号：
作者姓名：
姚迪;常红岩;王琳
作者机构：
郑州大学第一附属医院 信息处,河南 郑州 450052
文献出处：
引用格式：
[1]姚迪;常红岩;王琳-.利用生物信息技术及基础实验检验食管鳞癌中白细胞介素-17及相关细胞因子表达情况)[J].河南医学研究,2022(10):1785-1789
A类：
B类：
利用生物,生物信息技术,基础实验,食管鳞癌,技术探索,文献计量学方法,肿瘤相关,相关基因表达,基因表达综合数据库,GEO,关键基因表达,不同分期,癌肿,组织标本,搜索数据,纳入标准,标准文献,钙结合蛋白,S100A8,S100A9,基质金属蛋白酶,MMP,RStudio,GSE26886,肿瘤组织,组织中表达,较正,正常组织,低于正常,免疫组化检测,癌组织,组织表达,热度,蛋白质免疫印迹,果类,数据库检测,实践结果,研究目的
AB值：
0.266218
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